The problem of estimating recent genetic connectivity in a changing world
Notice bibliographique
Résumé
Accurate understanding of population connectivity is important to conservation because dispersal can play an important role in population dynamics, microevolution, and assessments of extirpation risk and population rescue. Genetic methods are increasingly used to infer population connectivity because advances in technology have made them more advantageous (e.g., cost effective) relative to ecological methods. Given the reductions in wildlife population connectivity since the Industrial Revolution and more recent drastic reductions from habitat loss, it is important to know the accuracy of and biases in genetic connectivity estimators when connectivity has declined recently. Using simulated data, we investigated the accuracy and bias of 2 common estimators of migration (movement of individuals among populations) rate. We focused on the timing of the connectivity change and the magnitude of that change on the estimates of migration by using a coalescent-based method (Migrate-n) and a disequilibrium-based method (BayesAss). Contrary to expectations, when historically high connectivity had declined recently: (i) both methods over-estimated recent migration rates; (ii) the coalescent-based method (Migrate-n) provided better estimates of recent migration rate than the disequilibrium-based method (BayesAss); (iii) the coalescent-based method did not accurately reflect long-term genetic connectivity. Overall, our results highlight the problems with comparing coalescent and disequilibrium estimates to make inferences about the effects of recent landscape change on genetic connectivity among populations. We found that contrasting these 2 estimates to make inferences about genetic-connectivity changes over time could lead to inaccurate conclusions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,014 | 0,127 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».