Comparative population structure and trichothecene mycotoxin profiling of <i>Fusarium graminearum</i> from corn and wheat in Ontario, central Canada
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium graminearum causes fusarium head blight ( FHB ) of wheat and gibberella ear rot ( GER ) of corn in Canada and also contaminates grains with trichothecene mycotoxins. Very little is known about trichothecene diversity and population structure of the fungus from corn in Ontario, central Canada. Trichothecene genotypes of F . graminearum isolated from corn ( n = 452) and wheat ( n = 110) from 2010 to 2012 were identified. All the isolates were deoxynivalenol ( DON ) type. About 96% of corn isolates and 98% of wheat isolates were 15‐acetyl deoxynivalenol (15 ADON ) type. The fungal population structures from corn ( n = 313) and wheat ( n = 73) were compared using 10 variable number tandem repeat ( VNTR ) markers. The fungal populations and subpopulations categorized based on host, cultivar groups, years and geography showed high gene ( H = 0.818–0.928) and genotypic ( GD = 0.999–1.00) diversity. Gene flow was also high between corn and wheat population pairs ( Nm = 8.212), and subpopulation pairs within corn ( Nm = 7.13–23.614) or wheat ( Nm = 19.483) populations. Phylogenetic analysis revealed that isolates from both hosts were F. graminearum clade 7. These findings provide baseline data on 3‐acetyl deoxynivalenol (3 ADON ) and 15 ADON profiles of F . graminearum isolates from corn in Canada and are useful in evaluating mycotoxin contamination risks in corn and wheat grains. Understanding the fungal genetic structure will assist evaluation and development of resistant cultivars/germplasm for FHB on wheat and GER on corn.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».