Impact of Insertions in the HIV-1 P6 Ptapp Region on the Virological Response to Amprenavir
Notice bibliographique
Résumé
We evaluated the impact of genetic changes within p6Gag gene on the virological response (VR, mean decrease in plasma viral load at week 12) to unboosted amprenavir (APV). Gag-protease fragments, including gag p2, p7, p1, p6 regions and whole protease (PR) were sequenced from baseline plasma specimens of 84 highly pre-treated but APV-naive patients included in the NARVAL (ANRS 088) trial. The correlation between baseline p6Gag polymorphism, PR mutations, baseline characteristics and VR to APV was analysed in univariate analysis. Insertions (P459Ins) within p6 protein, leading to partial or complete duplication of the PTAPP motif, were significantly associated with a decreased VR (P459Ins versus wild-type; -0.3 +/- 0.8 vs -1.1 +/- 1.2 log copies/ml, P=0.007) and were more frequent when the V82A/F/T/S PR mutation was present (P=0.020). In multivariate analysis, after adjustment on the predictive factors of the VR in the NARVAL trial and on the PR mutations linked with response, there was a strong trend to an association (P=0.058) between the presence of P459Ins and an altered VR. In conclusion, these results suggest that insertions in the p6 region of HIV-1 gag gene may affect the VR, in highly pre-treated patients receiving an unboosted APV-containing regimen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».