MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2402419670 · doi:10.1385/1-59259-294-5:219

Glycoprotein Analysis by Capillary Zone Electrophoresis-Electrospray Mass Spectrometry

2003· article· en· W2402419670 sur OpenAlexaff
Kevin P. Bateman, John F. Kelly, Pierre Thibault, Louis Ramaley, Robert L. White

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensDalhousie UniversityNational Research Council CanadaInstitute for Biological SciencesCaprion (Canada)Merck Canada Inc. (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryCapillary electrophoresisMass spectrometryGlycosidic bondChromatographyGlycoproteinGlycopeptideGlycanElectrosprayOligosaccharideTandem mass spectrometryOxonium ionProtein mass spectrometryBiochemistryEnzymeIonOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of glycoproteins as intact molecules or as smaller fragments generated by chemical or enzymatic digestion is well suited to the technique of capillary zone electrophoresis-electrospray mass spectrometry (CZE-ESMS). Separation of glycoform populations of intact glycoproteins or protein digests is possible using buffers compatible with mass spectrometric detection (1–8). CZE-ESMS analysis of intact proteins can provide semiquantitative information about the degree of heterogeneity of the glycoprotein (1,6,7). Enzymatic or chemical digestion of the glycoprotein, followed by CZE-ESMS, gives a direct measure of individual sites of heterogeneity (1–5). Combined CZE-collision induced dissociation (CID) mass spectrometric experiments (CZE-MS-MS) of digests enables the characterization of oligosaccharide structures (1–5). In particular, CID of glycopeptides is characterized by fragment ions corresponding to cleavage at each glycosidic bond. The occurrence of specific carbohydrate residues such as hexose (Man, Glc, Gal), N-acetylhexosamine (GlcNAc, GalNAc), or N-acetylneuraminic acid (NeuNAc) can be monitored by the observation of characteristic oxonium ions at m/z 163, 204, and 292, respectively. More recently, CZE-front-end CID-MS-MS has been shown to be a powerful tool for peptide sequencing of glycopeptides using subpicomole quantities of injected glycoprotein (3–5).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,267
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHumana Press eBooksMême sujetGlycosylation and Glycoproteins ResearchTravaux en français237 207