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Enregistrement W2402962887 · doi:10.1373/clinchem.2015.253716

Direct Comparison of Metastasis-Related miRNAs Expression Levels in Circulating Tumor Cells, Corresponding Plasma, and Primary Tumors of Breast Cancer Patients

2016· article· en· W2402962887 sur OpenAlexaff
Athina Markou, Martha Zavridou, Ioanna Sourvinou, George M. Yousef, Sofia Kounelis, Nikos Malamos, Vasilis Georgoulias, Evi Lianidou

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCirculating tumor cellmicroRNABreast cancerMetastasisPrimary tumorCancerMetastatic breast cancerMedicinePathologyCancer researchOncologyInternal medicineBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Circulating tumor cells (CTCs) and microRNAs (miRNAs) are important in liquid biopsies in which peripheral blood is used to characterize the evolution of solid tumors. We evaluated the expression levels of miR-21, miR-146a, miR-200c, and miR-210 in CTCs of breast cancer patients with verified metastasis and compared their expression levels in corresponding plasma and primary tumors. METHODS: Expression levels of the miRNAs were quantified by quantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR) in (a) 89 primary breast tumors and 30 noncancerous breast tissues and (b) CTCs and corresponding plasma of 55 patients with metastatic breast cancer and 20 healthy donors. For 30 of these patients, CTCs, corresponding plasma, and primary tumor tissues were available. RESULTS: In formalin-fixed, paraffin-embedded tissues, these miRNAs were differentially expressed between primary breast tumors and noncancerous breast tissues. miR-21 (P < 0.001) and miR-146a (P = 0.001) were overexpressed, whereas miR-200c (P = 0.004) and miR-210 (P = 0.002) were underexpressed. In multivariate analysis, miR-146a overexpression was significantly [hazard ratio 2.969 (1.231-7.157), P = 0.015] associated with progression-free survival. In peripheral blood, all miRNAs studied were overexpressed in both CTC and corresponding plasma. There was a significant association between miR-21 expression levels in CTCs and plasma for 36 of 55 samples (P = 0.008). In plasma, ROC curve analysis revealed that miR-21, miR-146a, and miR-210 could discriminate patients from healthy individuals. CONCLUSIONS: Metastasis-related miRNAs are overexpressed in CTCs and corresponding plasma; miR-21 expression levels highly correlate in CTCs and plasma; and miR-21, miR-146a, and miR-210 are valuable plasma biomarkers for discriminating patients from healthy individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,187
Score d'incertitude au seuil0,520

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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