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Enregistrement W2403520411 · doi:10.1101/054262

Best Practices in Data Analysis and Sharing in Neuroimaging using MRI

2016· preprint· en· W2403520411 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesInstituto Nacional de Psiquiatría Ramón de la Fuente MuñizNational University of SingaporeChild Mind InstituteMedical Research CouncilUniversity of WarwickMcGill University
Mots-clésNeuroimagingBest practiceTransparency (behavior)Data sharingOpen scienceData scienceComputer sciencePsychologyMedicinePolitical scienceNeurosciencePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neuroimaging enables rich noninvasive measurements of human brain activity, but translating such data into neuroscientific insights and clinical applications requires complex analyses and collaboration among a diverse array of researchers. The open science movement is reshaping scientific culture and addressing the challenges of transparency and reproducibility of research. To advance open science in neuroimaging the Organization for Human Brain Mapping created the Committee on Best Practice in Data Analysis and Sharing (COBIDAS), charged with creating a report that collects best practice recommendations from experts and the entire brain imaging community. The purpose of this work is to elaborate the principles of open and reproducible research for neuroimaging using Magnetic Resonance Imaging (MRI), and then distill these principles to specific research practices. Many elements of a study are so varied that practice cannot be prescribed, but for these areas we detail the information that must be reported to fully understand and potentially replicate a study. For other elements of a study, like statistical modelling where specific poor practices can be identified, and the emerging areas of data sharing and reproducibility, we detail both good practice and reporting standards. For each of seven areas of a study we provide tabular listing of over 100 items to help plan, execute, report and share research in the most transparent fashion. Whether for individual scientists, or for editors and reviewers, we hope these guidelines serve as a benchmark, to raise the standards of practice and reporting in neuroimaging using MRI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,447
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,005
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,121
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle