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Enregistrement W2403554365 · doi:10.1002/jctb.5024

Construction and optimization of <i>trans</i>‐4‐hydroxy‐L‐proline production recombinant <i>E. coli</i> strain taking the glycerol as carbon source

2016· article· en· W2403554365 sur OpenAlexaff
Jinxia Wang, Zhenyu Zhang, Hedong Liu, Fubao Sun, Yue Chun, Jinguang Hu, Chundi Wang

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemical Technology & Biotechnology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGlycerolFermentationStrain (injury)Escherichia coliProlineChemistryFood scienceCarbon sourceCarbon fibersBiochemistryAmino acidBiologyMaterials scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BACKGROUND Trans‐4‐hydroxy‐L‐proline (Hyp) is a value‐added amino acid that is an applicable chiral building block in some industries, such as the pharmaceutical, cosmetic and healthcare industries. Given that glycerol is a good carbon source for microbial fermentation and a large amount of glycerol is produced by the biodiesel industry, this study investigated a value‐added Hyp fermentation from glycerol using an engineered Escherichia coli strain. RESULTS By optimizing the proline‐4‐hydroxylase (P4H) gene codons and vectors, a constructed recombinant Escherichia coli BL21 strain successfully converted L‐proline to Hyp. With a chemo‐physical combination mutagenesis, a high Hyp production strain that can grow with glycerol as a sole carbon source, NA45 was isolated, yielding 1.24 g L−1 from 20 g L−1 glycerol at 12 h in a 30 mL/250 mL conical flask fermentation. With further systemic optimization of nutritional elements, the output was enhanced to 1.62 g L−1. In a 5 L fermentator, the strain achieved a surprisingly high output of 25.4 g L−1 at 48 h in fed batch mode. CONCLUSION A high Hyp production strain growing well on glycerol as carbon source was successfully engineered, which is a promising candidate for the industrial Hyp production. © 2016 Society of Chemical Industry

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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