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Enregistrement W2403667259 · doi:10.1385/1-59259-227-9:219

Antibodies for Detecting EBV Latent Proteins

2003· article· en· W2403667259 sur OpenAlexaff
Martin Rowe, Anja M. Mehl

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLytic cycleAntibodyMonoclonal antibodyEpstein–Barr virusImmunofluorescenceVirologyWestern blotBiologyVirusGeneMolecular biologyImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antibodies to many Epstein-Barr virus (EBV) gene products are present in sera from infected human carriers. Historically, the ready demonstration of antibodies to lytic cycle proteins in particular allowed the seroepidemiological studies, which implicated EBV as a factor in various diseases ( 1 – 4 ). However, human sera also contain antibodies to EBV latent gene products, as first demonstrated in an immunofluorescence test that detected predominantly EBNA1 ( 5 ). Subsequently, human sera proved to be remarkably useful reagents for detecting and characterizing various latent EBV proteins in Western blot assays (e.g., refs. 6 – 8 ). Indeed, even now that monoclonal antibodies (MAbs) are available to many of the EBV latent proteins, human sera continue to be useful for “EBNotyping” assays in which EBV isolates can be distinguished by virtue of the characteristic fingerprint of variable-sized EBNA proteins (e.g., refs. 9 – 12 ). An example of EBNotyping is shown in Fig. 1. EBNotyping of EBV-transformed B cell lines. Proteins from 10 6 cells were separated by Laemmli SDS-PAGE on a 7.5% acrylamide resolving gel in a large-format slab gel apparatus giving 16×16 cm gels. Lane 1 contains protein from an EBV-negative B cell line, and lanes 2 through 7 contain proteins from 6 lymphoblastoid cell lines, each transformed with a different EBV isolate. The upper blot was probed with a serum from a juvenile rheumatoid arthritis patient which showed reactivity with EBNAs 1, 2, 3A, 3B, and 3C, and that was unusual in showing little crossreactivity with cellular proteins. Variations in the size of the EBNA proteins between different EBV isolates produces a characteristic fingerprint, or EBNotype, that allows different EBV isolates to be distinguished. The lower blot of a second gel run in parallel with the first, was probed with a MAb, PE2, reactive with EBNA2. Comparison of the two blots enables the EBNA1 and EBNA2 bands to be identified in the upper blot, and in this panel of cell lines it is apparent that the EBNA1 proteins show considerable size variation. EBNA1 usually has a lower MWt than EBNA2, but these samples include two EBV isolates (lanes 2 and lane 5) where the EBNA1 protein clearly migrates more slowly than the EBNA2 band. These keywords were added by machine and not by the authors. This process is experimental and the keywords may be updated as the learning algorithm improves.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,071

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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