Molecular characterization of the polymicrobial flora in chronic rhinosinusitis.
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Conventional cultures have implicated Staphylococcus aureus (SA) and coagulase-negative Staphylococcus (CNS) as principal pathogens in chronic rhinosinusitis (CRS). These results are questioned by recent studies in which molecular probes implicate Haemophilus influenzae instead. OBJECTIVES: To identify all bacterial species present on sinonasal mucosa using molecular culture (bacterial tag-encoded FLX amplicon pyrosequencing [bTEFAP]) and to compare them with those identified with conventional methods. METHODS: A prospective study of 18 patients undergoing endoscopic sinus surgery for CRS and 9 control patients with pituitary adenomas was conducted. Per-operative mucosal biopsies were assessed with bTEFAP by sequencing the species-specific 16S ribosomal deoxyribonucleic acid (DNA) fragment for genetic identification of bacteria and then compared with simultaneous swab culture. RESULTS: Standard cultures showed mainly SA and CNS. Molecular cultures identified up to 20 organisms per sample. Surprisingly, anaerobic species predominated (Diaphorobacter and Peptoniphilus). SA was nevertheless detected in 50%. CONCLUSION: Molecular cultures such as bTEFAP are sensitive tools for bacterial identification in CRS and suggest that anaerobe involvement may be more frequent than presumed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».