Genomic analysis of gum disease and hypertrichosis in foxes
Notice bibliographique
Résumé
Since the 1940s, a proliferative gingival disease called hereditary hyperplastic gingivitis (HHG) has been described in the farmed silver fox, Vulpes vulpes (Dyrendahl and Henricson 1960). HHG displays an autosomal recessive transmission and has a pleiotropic relationship with superior fur quality in terms of length and thickness of guard hairs. An analogous human disease, hereditary gingival fibromatosis (HGF), is characterized by a predominantly autosomal dominant transmission and a complex etiology, occurring either as an isolated condition or as a part of a syndrome. Similar to HHG, the symptom most commonly associated with syndromic HGF is hypertrichosis. Here we explore potential mechanisms involved in HHG by comparison to known genetic information about hypertrichosis co-occurring with HGF, using an Affymetrix canine genome microarray platform, quantitative PCR, and candidate gene sequencing. We conclude that the mitogen-activated protein kinase pathway is involved in HHG, however despite involvement of the mitogen-activated protein kinase kinase 6 gene in congenital hypertrichosis with gingival fibromatosis in humans, this gene did not contain any fixed mutations in exons or exon-intron boundaries in HHG-affected foxes, suggesting that it is not causative of HHG in the farmed silver fox population. Differential up-regulation of MAP2K6 gene in HHG-affected foxes does implicate this gene in the HHG phenotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».