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Enregistrement W2404177877 · doi:10.1387/ijdb.12455633

Exogenous retinoic acid induces a stage-specific, transient and progressive extension of Sonic hedgehog expression across the pectoral fin bud of zebrafish

2002· article· en· W2404177877 sur OpenAlexafffund
Lisa Hoffman, Jennifer A. Miles, Fabien Avaron, Lynda Laforest, Marie‐Andrée Akimenko

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Developmental Biology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésSonic hedgehogZone of polarizing activityBiologyApical ectodermal ridgeRetinoic acidEctodermZebrafishLimb budCell biologyMesenchymeMesodermAnatomyMesenchymal stem cellEmbryogenesisEmbryoGeneticsSignal transductionEmbryonic stem cellCell cultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have performed a time course analysis of the expression of Sonichedgehog (shh) and patched1 (ptc1) in response to exogenous retinoic acid (RA) application to get some insight into the mechanism(s) underlying the formation of a mirror-image duplication of shh and ptc1 domains of expression in the pectoral fin buds of zebrafish. We have shown that RA exposure during the early stages of pectoral fin development first results in a rapid decrease or complete loss of shh/ptc1 expression. This is followed by reappearance of transcripts in the normal posterior domain, then by a stage-dependent and progressive expansion of the shh domain from the ZPA towards the anterior margin of the bud. Shh transcripts are induced in mesenchymal cells underlying the ventral ectoderm at the base of the bud. Once shh expression is activated in the most anterior cells, the number of shh-expressing cells increases in this region, possibly through an amplification mechanism involving signals from the apical ectodermal ridge. At this time, shh expression disappears from cells centrally located in the bud, resulting in the formation of the two distinct domains. An anterior extension of shh expression is also obtained in syu mutants with impaired shh function, suggesting that shh induction across the fin bud is independent of shh signaling. This study suggests the existence of complex mechanisms controlling the spatial and temporal expression of shh in the developing fin bud.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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