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Enregistrement W2404372454 · doi:10.1177/026119291404200405

Lung Fibrosis: Drug Screening and Disease Biomarker Identification with a Lung Slice Culture Model and Subtracted cDNA Library

2014· article· en· W2404372454 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAlternatives to Laboratory Animals · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensBio S&T (Canada)Concordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCTGFcDNA libraryFibrosisComplementary DNAHydroxyprolineBiologyPirfenidoneSuppression subtractive hybridizationLungMolecular biologyGenePathologyMedicineIdiopathic pulmonary fibrosisInternal medicineGeneticsBiochemistryGrowth factorReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pulmonary fibrosis is a progressive and irreversible disorder with no appropriate cure. A practical and effective experimental model that recapitulates the disease will greatly benefit the research community and, ultimately, patients. In this study, we tested the lung slice culture (LSC) system for its potential use in drug screening and disease biomarker identification. Fibrosis was induced by treating rat lung slices with 1ng/ml TGF-β1 and 2.5μM CdCl2, quantified by measuring the content of hydroxyproline, and confirmed by detecting the expression of collagen type III alpha 1 (Col3α1) and connective tissue growth factor (CTGF) genes. The anti-fibrotic effects of pirfenidone, spironolactone and eplerenone were assessed by their capability to reduce hydroxyproline content. A subtractive hybridisation technique was used to create two cDNA libraries (subtracted and unsubtracted) from lung slices. The housekeeping gene glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) was employed to assess the subtraction efficiency of the subtracted cDNA library. Clones from the two libraries were sequenced and the genes were identified by performing a BLAST search on the NCBI GenBank database. Furthermore, the relevance of the genes to fibrosis formation was verified. The results presented here show that fibrosis was effectively induced in cultured lung slices, which exhibited significantly elevated levels of hydroxyproline and Col3α1/CTGF gene expression. Several inhibitors have demonstrated their anti-fibrotic effects by significantly reducing hydroxyproline content. The subtracted cDNA library, which was enriched for differentially expressed genes, was used to successfully identify genes associated with fibrosis. Collectively, the results indicate that our LSC system is an effective model for the screening of drug candidates and for disease biomarker identification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,666
Score d'incertitude au seuil0,901

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle