Whole genome sequence analysis of an Alachlor and Endosulfan degrading Pseudomonas strain W15Feb9B isolated from Ochlockonee River, Florida
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
We recently isolated a Pseudomonas sp. strain W15Feb9B from Ochlockonee River, Florida and demonstrated potent biodegradative activity against two commonly used pesticides - Alachlor [(2-chloro-2',6'-diethylphenyl-N (methoxymethyl)acetanilide)] and Endosulfan [(6,7,8,9,10,10-hexachloro-1,5,5a,6,9,9a-hexahydro-6,9methano-2,3,4-benzo(e)di-oxathiepin-3-oxide], respectively. To further identify the repertoire of metabolic functions possessed by strain W15Feb9B, a draft genome sequence was obtained, assembled, annotated and analyzed. The genome sequence of strain 2385 has been deposited in GenBank under accession number JTKF00000000; BioSample number SAMN03151543. The sequences obtained from strain 2385 assembled into 192 contigs with a genome size of 6,031,588, G + C content of 60.34, and 5512 total number of putative genes. RAST annotated a total of 542 subsystems in the genome of strain W15Feb9B along with the presence of 5360 coding sequences. A genome wide survey of strain W15Feb9B indicated that it has the potential to degrade several other pollutants including atrazine, caprolactam, dioxin, PAHs (such as naphthalene) and several chloroaromatic compounds.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle