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Enregistrement W2404527239 · doi:10.3389/fnins.2016.00247

Microstructure Informed Tractography: Pitfalls and Open Challenges

2016· article· en· W2404527239 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroscience · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTractographyComputer scienceDiffusion MRIData scienceArtificial intelligenceMedicineMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One of the major limitations of diffusion MRI tractography is that the fiber tracts recovered by existing algorithms are not truly quantitative. Local techniques for estimating more quantitative features of the tissue microstructure exist, but their combination with tractography has always been considered intractable. Recent advances in local and global modeling made it possible to fill this gap and a number of promising techniques for microstructure informed tractography have been suggested, opening new and exciting perspectives for the quantification of brain connectivity. The ease-of-use of the proposed solutions made it very attractive for researchers to include such advanced methods in their analyses; however, this apparent simplicity should not hide some critical open questions raised by the complexity of these very high-dimensional problems, otherwise some fundamental issues may be pushed into the background. The aim of this article is to raise awareness in the diffusion MRI community, notably researchers working on brain connectivity, about some potential pitfalls and modeling choices that make the interpretation of the outcomes from these novel techniques rather cumbersome. Through a series of experiments on synthetic and real data, we illustrate practical situations where erroneous and severely biased conclusions may be drawn about the connectivity if these pitfalls are overlooked, like the presence of partial/missing/duplicate fibers or the critical importance of the diffusion model adopted. Microstructure informed tractography is a young but very promising technology, and by acknowledging its current limitations as done in this paper, we hope our observations will trigger further research in this direction and new ideas for truly quantitative and biologically meaningful analyses of the connectivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,311
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle