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Enregistrement W2404724518 · doi:10.1007/978-1-61779-160-4_23

Study of G Protein-Coupled Receptor/β-arrestin Interactions Within Endosomes Using FRAP

2011· article· en· W2404724518 sur OpenAlexafffund
Benjamin Aguila, May Simaan, Stéphane A. Laporte

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésG protein-coupled receptorEndosomeArrestinFluorescence recovery after photobleachingCell biologyYellow fluorescent proteinChemistryScaffold proteinReceptorG proteinHEK 293 cellsIntracellularBiologySignal transductionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

β-arrestins, through their scaffolding functions, are key regulators of G protein-coupled receptor (GPCR) signaling and intracellular trafficking. However, little is known about the dynamics of β-arrestin/receptor interactions and how these complexes, and complexes with other regulatory proteins, are controlled in cells. Here, we use yellow fluorescent protein (YFP)-tagged β-arrestin 2 and a fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) imaging approach to probe the real-time interaction of β-arrestin with a GPCR, the bradykinin type 2 receptor (B2R). We provide a detailed protocol to assess the avidity of β-arrestin2-YFP for B2R within endosomes in HEK293 cells. β-arrestin2-YFP associated with internalized receptors is photobleached with intense light, and fluorescence recovery due to the entry of nonbleached β-arrestin2-YFP is monitored over time as a measure of the rate exchange of β-arrestin2-YFP within the endosome. This approach can be extended to other GPCR/β-arrestin complexes and their putative regulators to provide information about the kinetics of similar protein-protein interactions in cells. Moreover, these techniques should provide insight into the role of β-arrestins in the intracellular trafficking and signaling of GPCRs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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