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Enregistrement W2404817041 · doi:10.1007/s41048-015-0003-2

Solubilization and purification of recombinant modified C-reactive protein from inclusion bodies using reversible anhydride modification

2015· article· en· W2404817041 sur OpenAlexaff
Lawrence A. Potempa, Zhenyu Yao, Shang‐Rong Ji, János G. Filep, Yi Wu

Notice bibliographique

RevueBiophysics Reports · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipokines, Inflammation, and Metabolic Diseases
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-RosemontUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntigenicityGene isoformReagentProtein subunitChemistryBiochemistryInclusion bodiesRecombinant DNAAntibodyBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The precise function of C-reactive protein (CRP) as a regulator of inflammation in health and disease continues to evolve. The true understanding of its role in host defense responses has been hampered by numerous reports of comparable systems with contradictory interpretations of CRP as a stimulator, suppressor, or benign contributor to such processes. These discrepancies may be explained in part by the existence of a naturally occurring CRP isoform, termed modified CRP (i.e., mCRP), that is expressed when CRP subunits are dissociated into monomeric structures. The free mCRP subunit undergoes a non-proteolytic conformational change that has unique solubility, antigenicity, and bioactivity compared to the subunits that remain associated in the native, pentameric CRP molecule (i.e., pCRP). As specific reagents have been developed to identify and quantify mCRP, it has become apparent that this isoform can be formed spontaneously in calcium-free solutions. Furthermore, mCRP can be expressed on perturbed cell membranes with as little as 24–48 h incubation in tissue culture. Because mCRP has the same size as pCRP subunits as evaluated by SDS-PAGE, its presence in a pCRP reagent would not be apparent using this technique to evaluate purity. Finally, because many antibody reagents purported to be specific for “CRP” contains some, or substantial specificity to mCRP, antigen-detection techniques using such reagents may fail to distinguish the specific CRP isoform detected. All these caveats concerning CRP structures and measurements suggest that the aforementioned contradictory studies may reflect to some extent on distinctive bioactivities of mCRP rather than on pCRP. To provide a reliable, abundant supply of mCRP for separate and comparable studies, a recombinant protein was engineered and expressed in E. coli (i.e., recombinant mCRP or r m CRP). Synthesized protein was produced as inclusion bodies which proved difficult to solubilize for purification and characterization. Herein, we describe a method using anhydride reagents to effectively solubilize r m CRP and allow for chromatographic purification in high yield and free of contaminating endotoxin. Furthermore, the purified r m CRP reagent represents an excellent comparable protein to the biologically produced mCRP and as a distinctive reagent from pCRP. Deciphering the true function of CRP in both health and disease requires a knowledge, understanding, and reliable supply of each of its structures so to define the distinctive effects of each on the body’s response to tissue damaging events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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