Correlation of Clinical Outcomes With Multiplex Molecular Testing of Stool From Children Admitted to Hospital With Gastroenteritis in Botswana
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Diarrheal disease is a leading cause of death for young children. Most pediatric gastroenteritis is caused by viral pathogens; consequently, current recommendations advocate against routine antibacterial therapy if children present without bloody stools. METHODS: In this prospective cohort study, we enrolled children with severe acute gastroenteritis admitted to hospital in Botswana. Details of presenting history, physical examination, and course in the hospital were recorded. Stool samples were characterized using a 15 pathogen polymerase chain reaction assay. RESULTS: There were 671 participants with a median age of 8.3 months; 77 (11%) had severe acute malnutrition. Only 74 children had bloody stools, of whom 48 (65%) had a detectable bacterial pathogen, compared to 195 of 592 (33%) of those without. There were 26 deaths (3.9%). Covariates associated with death in multivariable logistic regression were the detection of any of Campylobacter/Shigella/enterotoxigenic Escherichia coli (odds ratio [OR] 2.57, 95% confidence interval [CI] 1.07-6.17), severe acute malnutrition (OR 4.34, 95% CI 1.79-10.5), and antibiotic therapy (OR 8.82, 95% CI 2.03-38.2). There was no significant association between bloody stools and death, and the effect of Campylobacter/Shigella/enterotoxigenic E. coli infection on death was not modified by the presence of bloody stools. CONCLUSIONS: Detection of bacterial enteropathogens is associated with increased mortality in children in sub-Saharan Africa. Unfortunately, most children with these infections do not have bloody stools, and bloody dysentery was not found to be associated with worse outcomes. Clinical trials evaluating outcomes associated with more aggressive diagnostic strategies in children presenting with severe acute gastroenteritis in sub-Saharan Africa should be undertaken.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».