Analysis of Novel Interactions between Components of the Selenocysteine Biosynthesis Pathway, SEPHS1, SEPHS2, SEPSECS, and SECp43
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Notice bibliographique
Résumé
In mammalian cells, the incorporation of the 21st amino acid, selenocysteine, into proteins is guided by the Sec machinery. The function of this protein complex requires several protein-protein and protein-RNA interactions, leading to the incorporation of selenocysteine at UGA codons. It is guided by stem-loop structures localized in the 3' untranslated regions of the selenoprotein-encoding genes. Here, we conducted a global analysis of interactions between the Sec biosynthesis and incorporation components using a bioluminescence resonance energy transfer assay in mammalian cells that showed that selenocysteine synthase (SEPSECS), SECp43, and selenophosphate synthetases SEPHS1 and SEPHS2 form oligomers in eukaryotic cells. We also showed that SEPHS2 interacts with SEPSECS and SEPHS1; these interactions were confirmed by co-immunoprecipitation. To further analyze the interactions of SECp43, the protein was expressed in Escherichia coli, and small-angle X-ray scattering analysis revealed that it is a globular protein comprising two RNA-binding domains. Using phage display, we identified potential interaction sites and highlighted two residues (K166 and P167) required for its dimerization. The SECp43 structural model presented here constitutes the basis of future exploration of the protein-protein interactions among early components of the selenocysteine biosynthesis and incorporation pathway.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle