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Enregistrement W2408082652

[Activation of multiple tumor suppressor genes by MBD1 siRNA in pancreatic cancer cell line BxPC-3].

2008· article· en· W2408082652 sur OpenAlexaff
Jin Xu, Chen Liu, Xianjun Yu, Chen Jin, De Liang Fu, Quan Xing Ni

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2008
Typearticle
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensPancreas Centre (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransfectionp14arfPlasmidMolecular biologyCancer researchPancreatic cancerLipofectamineCarcinogenesisCDH1Cell cultureRecombinant DNATumor suppressor geneBiologyGeneCancerCellGeneticsVector (molecular biology)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To observe the effect of MBD1-siRNA on the expressions of multiple tumor suppressor genes in pancreatic cancer cells, and to explore the role of MBD1 in carcinogenesis of pancreatic carcinoma. METHODS: Two siRNA sequences targeting MBD1 were designed by software and cloned into the expression plasmid pGCsi-U6/Neo/GFP. DNA sequencing was used to confirm if the recombinant plasmid was constructed correctly. The constructed plasmid and the blank plasmid pGCsi-U6/Neo/GFP were stably transfected into human pancreatic cancer cells of the line BxPC-3. Nude mice underwent subcutaneous injection of the BxPC-3 cells transfected with the plasmid pGCsi-U6/Neo/GFP containing MBD1 or the blank plasmid pGCsi-U6/Neo/GFP to establish tumor models and were observed for 8 weeks. Mice without inoculation were used as controls. Eight weeks later the mice were killed with the tumors taken out. RT-PCR was used to detect the mRNA expression of MBD1 and the tumor suppressor genes related with DNA methylation, including CDH1, RASSF1A, TIMP3, P14ARF and Rb in transplanted tumors. RESULTS: MBD1-siRNA recombinant plasmids were constructed successfully and stably transfected into the BxPC-3 cells. MBD1 was not detected in the tumors of the MBD1-siRNA group and could be found in the other 2 groups. However, the mRNA expression levels of CDH1, RASSF1A, TIMP3, P14ARF, and Rb of the MBD1-siRNA group (179.7 +/- 8.1, 155.6 +/- 10.0, 256.7 +/- 15.7, 199.0 +/- 7.9, 210.1 +/- 9.4) were all significantly higher than those of the other 2 groups (21.0 +/- 6.8, 22.0 +/- 2.7, 99.4 +/- 10.3, 86.0 +/- 5.4, 15.0 +/- 4.9, 11.4 +/- 6.0, 15.3 +/- 1.9, 110.7 +/- 14.1, 74.3 +/- 4.8, 17.4 +/- 7.8, all P < 0.05). CONCLUSION: RNA interference decreases the expression of MBD1 in pancreatic cancer and up-regulate the transcription of tumor suppressor genes. MBD1 mediated transcriptional repression may play an important role in the development of pancreatic cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2008
Routes d'admission1
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