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Enregistrement W2408809089 · doi:10.1139/cjm-2016-0091

The <i>Sclerotinia sclerotiorum Slt2</i> mitogen-activated protein kinase ortholog, <i>SMK3</i>, is required for infection initiation but not lesion expansion

2016· article· en· W2408809089 sur OpenAlexafffundvenue
Zafer Dallal Bashi, Sanjaya Gyawali, Diana Bekkaoui, Cathy Coutu, Leora Lee, Jenny Poon, S. R. Rimmer, George G. Khachatourians, Dwayne D. Hegedus

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesGovernment of Canada
Mots-clésSclerotinia sclerotiorumBiologyCell biologyMAPK/ERK pathwayMutantHyphaProtein kinase AKinaseArabidopsisMicrobiologyGeneBotanyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitogen-activated protein kinases (MAPKs) play a central role in transferring signals and regulating gene expression in response to extracellular stimuli. An ortholog of the Saccharomyces cerevisiae cell wall integrity MAPK was identified in the phytopathogenic fungus Sclerotinia sclerotiorum. Disruption of the S. sclerotiorum Smk3 gene severely reduced virulence on intact host plant leaves but not on leaves stripped of cuticle wax. This was attributed to alterations in hyphal apical dominance leading to the inability to aggregate and form infection cushions. The mutation also caused loss of the ability to produce sclerotia, increased aerial hyphae formation, and altered hyphal hydrophobicity and cell wall integrity. Mutants had slower radial expansion rates on solid media but more tolerance to elevated temperatures. Loss of the SMK3 cell wall integrity MAPK appears to have impaired the ability of S. sclerotiorum to sense its surrounding environment, leading to misregulation of a variety of functions. Many of the phenotypes were similar to those observed in S. sclerotiorum adenylate cyclase and SMK1 MAPK mutants, suggesting that these signaling pathways co-regulate aspects of fungal growth, physiology, and pathogenicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,992

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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