Comparison of the Proinflammatory and Procoagulant Properties of Nuclear, Mitochondrial, and Bacterial DNA
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Cell-free DNA (CFDNA) is elevated in sepsis and correlates with mortality. This DNA may come from nuclear, mitochondrial, or bacterial sources. Cell-free DNA from all three sources may play a pathogenic role in sepsis via activation of coagulation through the contact pathway, whereas CpG motifs on bacterial and mitochondrial DNA may additionally stimulate inflammatory responses via Toll-like receptor 9. This study elucidates the relative effects of nuclear, mitochondrial, and bacterial DNA on inflammatory and procoagulant pathways with relevance to sepsis. METHODS: DNA was extracted from plasma of septic patients and control subjects, and nuclear and mitochondrial CFDNA concentrations were measured by quantitative polymerase chain reaction. Viability of primary cultured human neutrophils was measured by flow cytometry for phosphatidyl serine exposure and cell permeability to propidium iodide. Continuous thrombin generation was measured with a fluorogenic substrate (Technothrombin, Vienna, Austria). Interleukin 6 secretion was measured by enzyme-linked immunosorbent assay. Platelet activation was measured by flow cytometry for P-selectin and activated αIIbβ3. RESULTS: Mitochondrial DNA and nuclear DNA were elevated in plasma from septic patients compared with control subjects. Both mitochondrial and bacterial DNA prolonged neutrophil viability. Bacterial DNA increased neutrophil interleukin 6 secretion, but mitochondrial and nuclear DNA did not. Nuclear, mitochondrial, and bacterial DNA increased thrombin generation in platelet-poor plasma to a similar degree in a FXI- and FXII-dependent manner, indicating dependence on the intrinsic pathway of coagulation. Independently of coagulation, DNA from all three sources was capable of causing activation of platelet integrin αIIbβ3. CONCLUSIONS: Cell-free DNA from nuclear, mitochondrial, and bacterial sources have varying proinflammatory effects, although all three have similar procoagulant and platelet-stimulating potential. The pathophysiological effects of CFDNA in sepsis may vary with the source of DNA.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».