MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2409769800 · doi:10.1073/pnas.1601256113

A class II KNOX gene, <i>KNOX4</i> , controls seed physical dormancy

2016· article· en· W2409769800 sur OpenAlexaff
Maofeng Chai, Chuanen Zhou, Isabel Molina, Chunxiang Fu, Jin Nakashima, Guifen Li, Wenzheng Zhang, Jongjin Park, Yuhong Tang, Qingzhen Jiang, Zeng‐Yu Wang

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensAlgoma University
Organismes subventionnairesBiological and Environmental ResearchOffice of ScienceSamuel Roberts Noble FoundationU.S. Department of Energy
Mots-clésDormancyBiologyMutantSeed dormancyMedicago truncatulaCutinGeneWild typeGeneticsBotanyGermination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Physical dormancy of seed is an adaptive trait that widely exists in higher plants. This kind of dormancy is caused by a water-impermeable layer that blocks water and oxygen from the surrounding environment and keeps embryos in a viable status for a long time. Most of the work on hardseededness has focused on morphological structure and phenolic content of seed coat. The molecular mechanism underlying physical dormancy remains largely elusive. By screening a large number of Tnt1 retrotransposon-tagged Medicago truncatula lines, we identified nondormant seed mutants from this model legume species. Unlike wild-type hard seeds exhibiting physical dormancy, the mature mutant seeds imbibed water quickly and germinated easily, without the need for scarification. Microscopic observations of cross sections showed that the mutant phenotype was caused by a dysfunctional palisade cuticle layer in the seed coat. Chemical analysis found differences in lipid monomer composition between the wild-type and mutant seed coats. Genetic and molecular analyses revealed that a class II KNOTTED-like homeobox (KNOXII) gene, KNOX4, was responsible for the loss of physical dormancy in the seeds of the mutants. Microarray and chromatin immunoprecipitation analyses identified CYP86A, a gene associated with cutin biosynthesis, as one of the downstream target genes of KNOX4 This study elucidated a novel molecular mechanism of physical dormancy and revealed a new role of class II KNOX genes. Furthermore, KNOX4-like genes exist widely in seed plants but are lacking in nonseed species, indicating that KNOX4 may have diverged from the other KNOXII genes during the evolution of seed plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,425
Score d'incertitude au seuil0,244

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueProceedings of the National Academy of SciencesMême sujetSeed Germination and PhysiologyTravaux en français237 207