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Enregistrement W2409959742

[Application studies on the gene diagnosis and carrier detection of hemophilia A by using polymerase chain reaction-conformation sensitive gel electrophoresis].

2009· article· en· W2409959742 sur OpenAlexaff
David Lillicrap, Guoping He, Jayne Leggo, Yusheng Liu, Xianhong Tong, Guixiang Zhou, Li-hua Luo

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemophilia Treatment and Research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProbandPolymerase chain reactionGeneticsExonPedigree chartIntronGeneMolecular biologyAmpliconMutationBiology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To establish a simple, rapid and easy method for screening the gene mutation in hemophilia A, which was further applied to a direct diagnosis and carrier detection at gene level. METHODS: Twenty-four clinically diagnosed hemophilia pedigrees, including all the hemophilia patients and female members, were tested for the introns 22 and 1 in factor VIII gene by using inversion polymerase chain reaction (PCR) and regular PCR techniques. All the 26 exons of factor VIII gene were consecutively screened in the 17 patients manifesting non-inverted sequences in intron 22 by using PCR, subsequently all the 37 amplicons resulted from 26 exons were analyzed by conformation sensitive gel electrophoresis (CSGE), finally the mutated exons were subjected to sequencing verification. According to the mutation results, mothers and twin sisters of the hemophilia probands were tested by CSGE or subjected to nucleotide sequencing directly, to ascertain if those individuals had the same mutation or were the carriers of disease-causing gene. RESULTS: Intron 22 inversion was detected in 7 hemophilia probands out of 24 hemophilia pedigrees, intron 1 inversion was not detected in these pedigrees. Single-base mutations distributed in different exons of factor VIII gene were detected in 13 pedigrees with family history and 3 sporadic pedigrees, diagnosed as non-inverted 22 intron patients. By comprehensive usage of PCR-CSGE and nucleotide sequencing, the positive rate and the diagnosable rate of gene diagnosis or carrier detection in the 24 hemophilia pedigrees was 94.12% and 100% respectively. CONCLUSION: PCR-CSGE is a highly sensitive and special assay for detecting single base mutation. By integrated utilization of introns 22 and 1 of factor VIII gene detection and PCR-CSGE genotyping, combining with nucleotide sequencing, a direct diagnosis of all hemophilia pedigrees be could nearly make at gene level, including the sporadic families. This method might be used to screen new mutation theoretically and ascertain the mutation type. It is a simple, rapid and low-cost method, possessing unique advantages in direct diagnosis of hemophilia A and carrier screening. It should have important application value in hemophilia diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
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