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Enregistrement W2410047227 · doi:10.1016/j.jalz.2015.06.250

P1‐053: Associations between TLR4 Asp299Gly variant and Alzheimer's‐related pathological biomarkers

2015· article· en· W2410047227 sur OpenAlexaffabout
Cynthia Picard, Mélissa Savard, John C.S. Breitner, Judes Poirier

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortMedicineMissense mutationMinor allele frequencyPopulationGenotypingRepeatable Battery for the Assessment of Neuropsychological StatusInternal medicineAllele frequencyAlleleAlzheimer's diseaseBiomarkerOncologyDiseaseGenotypeMutationGeneticsBiologyCognitive impairmentGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TLR4 is a member of the Toll-like receptor family which plays a role in pathogen recognition and activation of innate immunity. A common missense mutation (Asp299Gly) in the extracellular domain of the receptor was found in association with a blunted inflammatory response to inhaled toxins in humans. Carriage of the minor 299Gly allele seems to exert a protective effect as it was overrepresented in a Sicilian cohort of centenarians (14.6%). Conversely, the frequency of the 299Gly allele was significantly lower in LOAD cases (3.1%) compared to controls (7.2%) in an Italian population sample. The objectives of the present study are to determine the frequency of the 299Gly allele in three independent cohorts and to correlate these findings with available Alzheimer-related pathological biomarkers. Genotyping was performed with Illumina BeadChips for DNA samples from the Quebec Founder Population (QFP, n=629) and Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI, n=757). For the PREVENT-AD cohort (n=152), genotyping was performed using pyrosequencing. Classic AD biomarkers were measured by ELISA using CSF samples from the PREVENT-AD and ADNI cohorts. Structural and functional magnetic resonance imaging (MRI) was undertaken for a subgroup of participants. Repeatable Battery for the Assessment of Neuropsychological Status (RBANS) was also evaluated for the PREVENT-AD cohort. In the QFP, the 299Gly allele was present in 6.3% of LOAD cases and 10.7% of aged-matched control subjects (p≤0.005). Healthy subjects enrolled in the PREVENT-AD study (with a first-degree family history of AD) were positive for the 299Gly allele in a proportion of 12.5%. In ADNI, the 299Gly allele was detected in 9.5% of AD cases, 9.9% of MCI patients and 11.2% of control subjects (baseline diagnostic, p≥0.05). Although not associated with the disease in the latter population, the 299Gly allele significantly correlated with higher CSF APOE levels measured in MCI patients. In unaffected subjects from the PREVENT-AD cohort, the 299Gly allele was significantly associated with enhanced cortical thickness and a higher RBANS visuospatial score. The presence of the 299Gly allele is clearly associated with neuroprotection. Targeting TLR4 signaling pathway could be considered for pharmacological intervention to prevent Alzheimer's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,052

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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