Rhizobiales-like Phosphatase 2 from Arabidopsis thaliana Is a Novel Phospho-tyrosine-specific Phospho-protein Phosphatase (PPP) Family Protein Phosphatase
Notice bibliographique
Résumé
Cellular signaling through protein tyrosine phosphorylation is well established in mammalian cells. Although lacking the classic tyrosine kinases present in humans, plants have a tyrosine phospho-proteome that rivals human cells. Here we report a novel plant tyrosine phosphatase from Arabidopsis thaliana (AtRLPH2) that, surprisingly, has the sequence hallmarks of a phospho-serine/threonine phosphatase belonging to the PPP family. Rhizobiales/Rhodobacterales/Rhodospirillaceae-like phosphatases (RLPHs) are conserved in plants and several other eukaryotes, but not in animals. We demonstrate that AtRLPH2 is localized to the plant cell cytosol, is resistant to the classic serine/threonine phosphatase inhibitors okadaic acid and microcystin, but is inhibited by the tyrosine phosphatase inhibitor orthovanadate and is particularly sensitive to inhibition by the adenylates, ATP and ADP. AtRLPH2 displays remarkable selectivity toward tyrosine-phosphorylated peptides versus serine/threonine phospho-peptides and readily dephosphorylates a classic tyrosine phosphatase protein substrate, suggesting that in vivo it is a tyrosine phosphatase. To date, only one other tyrosine phosphatase is known in plants; thus AtRLPH2 represents one of the missing pieces in the plant tyrosine phosphatase repertoire and supports the concept of protein tyrosine phosphorylation as a key regulatory event in plants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».