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Enregistrement W2410974586 · doi:10.1021/acs.biochem.5b00442

Mimicking and Understanding the Agglutination Effect of the Antimicrobial Peptide Thanatin Using Model Phospholipid Vesicles

2015· article· en· W2410974586 sur OpenAlexafffund
Émile Robert, Thierry Lefèvre, Matthieu Fillion, Benjamin Martial, Justine Dionne, Michéle Auger

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversité LavalPROTEO
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaU.S. Food and Drug Administration
Mots-clésVesicleAgglutination (biology)PeptideAntimicrobialPhospholipidChemistryMicrobiologyBiochemistryBiologyAntigenImmunologyMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thanatin is a cationic 21-residue antimicrobial and antifongical peptide found in the spined soldier bug Podisus maculiventris. It is believed that it does not permeabilize membranes but rather induces the agglutination of bacteria and inhibits cellular respiration. To clarify its mode of action, lipid vesicle organization and aggregation propensity as well as peptide secondary structure have been studied using different membrane models. Dynamic light scattering and turbidimetry results show that specific mixtures of negatively charged and zwitterionic phospholipid vesicles are able to mimic the agglutination effect of thanatin observed on Gram-negative and Gram-positive bacterial cells, while monoconstituent ("conventional") models cannot reproduce this phenomenon. The model of eukaryotic cell reveals no particular interaction with thanatin, which is consistent with the literature. Infrared spectroscopy shows that under the conditions under which vesicle agglutination occurs, thanatin exhibits a particular spectral pattern in the amide I' region and in the region associated with Arg side chains. The data suggest that thanatin mainly retains its hairpin structure, Arg residues being involved in strong interactions with anionic groups of phospholipids. In the absence of vesicle agglutination, the peptide conformation and Arg side-chain environment are similar to those observed in solution. The data show that a negatively charged membrane is required for thanatin to be active, but this condition is insufficient. The activity of thanatin seems to be modulated by the charge surface density of membranes and thanatin concentration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,345

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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