Mimicking and Understanding the Agglutination Effect of the Antimicrobial Peptide Thanatin Using Model Phospholipid Vesicles
Notice bibliographique
Résumé
Thanatin is a cationic 21-residue antimicrobial and antifongical peptide found in the spined soldier bug Podisus maculiventris. It is believed that it does not permeabilize membranes but rather induces the agglutination of bacteria and inhibits cellular respiration. To clarify its mode of action, lipid vesicle organization and aggregation propensity as well as peptide secondary structure have been studied using different membrane models. Dynamic light scattering and turbidimetry results show that specific mixtures of negatively charged and zwitterionic phospholipid vesicles are able to mimic the agglutination effect of thanatin observed on Gram-negative and Gram-positive bacterial cells, while monoconstituent ("conventional") models cannot reproduce this phenomenon. The model of eukaryotic cell reveals no particular interaction with thanatin, which is consistent with the literature. Infrared spectroscopy shows that under the conditions under which vesicle agglutination occurs, thanatin exhibits a particular spectral pattern in the amide I' region and in the region associated with Arg side chains. The data suggest that thanatin mainly retains its hairpin structure, Arg residues being involved in strong interactions with anionic groups of phospholipids. In the absence of vesicle agglutination, the peptide conformation and Arg side-chain environment are similar to those observed in solution. The data show that a negatively charged membrane is required for thanatin to be active, but this condition is insufficient. The activity of thanatin seems to be modulated by the charge surface density of membranes and thanatin concentration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».