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Enregistrement W2411628978 · doi:10.1002/jcb.25621

Preservation of the 3D Phenotype Upon Dispersal of Cultured Cell Spheroids Into Monolayer Cultures

2016· article· en· W2411628978 sur OpenAlexafffund
Vasilij Koshkin, Laurie Ailles, Geoffrey Liu, Sergey N. Krylov

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoYork University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSpheroidPhenotypeFlow cytometryCellPopulationBiologyCell cycleCell biologyCell cultureCytotoxicityEffectorCytometryMolecular biologyChemistryIn vitroBiochemistryGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In functional cytometric studies, cultured cells are exposed to effectors (e.g., drugs), and the heterogeneity of cell responses are studied using cytometry techniques (e.g., image cytometry). Such studies are difficult to perform on 3D cell cultures. A solution is to disperse 3D clusters and transfer the cells to the 2D state before applying effectors and using cytometry. This approach requires that the lifetime of the 3D phenotype be longer than the duration of the experiment. Here we studied the dynamics of phenotype transformation from 3D to 2D and searched for means of slowing this transformation down in dispersed spheroids of MCF7 cells. We found three functional biomarkers of the 3D phenotype in MCF7 cell spheroids that are absent in the 2D cell culture: (i) the presence of a subpopulation with an elevated drug-expelling capacity; (ii) the presence of a subpopulation with an elevated cytoprotective capacity; and (iii) the accumulation of cells in the G1 phase of the cell cycle. Monitoring these biomarkers in cells transferred from the 3D state to the 2D state revealed their gradual extinction. We found that the combined application of an elevated cell density and thiol-containing medium supplements increased the lifetime of the 3D phenotype by several fold to as long as 96 h. Our results suggest that extending the lifetime of the 3D phenotype in the cells transferred from the 3D state to the 2D state can facilitate detailed functional cytometric studies, such as measurements of population heterogeneity of cytotoxicity, chemosensitivity, and radiosensitivity. J. Cell. Biochem. 118: 154-162, 2017. © 2016 Wiley Periodicals, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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