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Enregistrement W2411932867 · doi:10.1136/sextrans-2015-052270.136

O10.5 Rapid diagnosis of<i>trichomonas vaginalis</i>by testing vaginal swabs in an isothermal helicase-dependent amplivue<sup>®</sup>assay

2015· article· en· W2411932867 sur OpenAlexaff
Max Chernesky, C A Gaydos, Jeanne Marrazzo, Marcia M. Hobbs, Jane R. Schwebke

Notice bibliographique

RevueSexually Transmitted Infections · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrichomonas vaginalisMedicineLoop-mediated isothermal amplificationGynecologyTrichomonas VaginitisAsymptomaticInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Infections due to Trichomonas vaginalis are treatable. Diagnostic methods such as wet mount microscopy are rapid but insensitive. Culture or traditional molecular assays are more sensitive but lack rapid results. Biohelix (a Quidel company) has created an isothermal, cassette-based, point-of-care molecular amplified test for the diagnosis of T. vaginalis in vaginal samples which can provide a diagnosis in 5 min. The objective was to demonstrate the clinical performance of the AmpliVue® Trichomonas assay on vaginal swabs from women with or without symptoms living in 5 geographical areas of North America. Methods Women attending STD, family planning, colposcopy and OB/GYN clinics were invited to participate using an investigational research board approved consent form. A healthcare worker collected 4 swabs. The first and second swabs were randomised for wet mount and culture (In-Pouch system, Biomed Diagnostics). Cultures were inoculated and read at 2 and 3 days, and wet mount microscopy performed within 1 h of collection. The third was tested in AmpliVue® and the fourth in Aptima TV (ATV; Hologic, Inc), a transcription-mediated amplification assay. AmpliVue® and ATV testing was performed within 48 h. Positives by diagnostic method were compared to each other and agreements with kappa values were calculated between AmpliVue®and ATV. Results A total of 1132 women (373 symptomatic and 759 asymptomatic) were enrolled. Comparing AmpliVue® to culture and wet mount as a patient infected status demonstrated 100% sensitivity, 98.2% specificity and 87.9–100% positive and negative predictive values in patients with or without symptoms. AmpliVue® showed strong overall agreement with ATV (97.5% 0.89 kappa). Conclusion The AmpliVue Trichomonas Assay identified substantially more T. vaginalis infections and yielded accurate results in 45 min for the diagnosis and treatment of Trichomonas vaginalis in symptomatic and asymptomatic patients representing high and low-prevalence clinics. Clinicians can use this information for their clinics. Disclosure of interest statement Dr. Chernesky has received research funding from Quidel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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