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Enregistrement W2411973035 · doi:10.1385/1-59745-167-3:305

Soluble Adamantyl Glycosphingolipid Analogs as Probes of Glycosphingolipid Function

2006· review· en· W2411973035 sur OpenAlexaff
Clifford A. Lingwood, Skanda Sadacharan, Maan Abul-Milh, Murugespillai Mylvaganum, Marcus Peter

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2006
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSphingolipid Metabolism and Signaling
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycosphingolipidCeramideMoietyTransmembrane proteinFunction (biology)Lipid raftBiochemistryReceptorChemistryBiologyStereochemistryCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the extensive structural characterization of glycosphingolipids (GSLs), their functions in cell physiology and pathobiology remain elusive. This is largely owing to the fact that they are difficult to handle, being insoluble in aqueous media, and that no one gene alone determines their synthesis. The heterogeneity of the lipid moiety provides a further confounding factor. GSLs are central components within lipid rafts, which are major foci for transmembrane signaling and interactions between eukaryotic cells and microbial pathogens. GSL receptor function often requires the lipid moiety, and lipid-free sugar analogs are ineffective inhibitors. In order to overcome some of these problems, we have synthesized adamantyl GSL analogs which, in part, mimic GSL membrane receptor function in solution. These compounds are made by replacing the endogenous fatty acid with an adamantan frame. This rigid hydrophobic structure surprisingly increases the water solubility of the conjugate and retains receptor function. These GSL mimics provide probes to study GSL receptor function within cells. They compete with native GSLs for ligand binding and are taken up by cells to potentially alter GSL-mediated interaction. We are focused on two derivatives, adamantyl globotriaosyl ceramide and adamantyl sulfogalactosyl ceramide, and have used these analogs to probe GSL function in microbial pathology and hsp70 function. This chapter describes the syntheses and uses of these mimics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,974
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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