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Enregistrement W2412168910 · doi:10.1111/imb.12247

Transcriptome analysis provides insight into venom evolution in a seed‐parasitic wasp, <i>Megastigmus spermotrophus</i>

2016· article· en· W2412168910 sur OpenAlex
Amber R. Paulson, Cong-Doan Le, J. C. Dickson, Jürgen Ehlting, Patrick von Aderkas, Steve J. Perlman

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueInsect Molecular Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect and Arachnid Ecology and Behavior
Établissements canadiensCanadian Institute for Advanced ResearchUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyTranscriptomeVenomBotanyGeneEcologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One of the most striking host range transitions is the evolution of plant parasitism from animal parasitism. Parasitoid wasps that have secondarily evolved to attack plants (ie gall wasps and seed-feeders) demonstrate intimate associations with their hosts, yet the mechanism of plant-host manipulation is currently not known. There is, however, emerging evidence suggesting that ovipositional secretions play a role in plant manipulation. To investigate whether parasites have modified pre-existing adaptations to facilitate dramatic host shifts we aimed to characterize the expression of venom proteins in a plant parasite using a collection of parasitoid venom sequences as a guide. The transcriptome of a seed-feeding wasp, Megastigmus spermotrophus, was assembled de novo and three putative venoms were found to be highly expressed in adult females. One of these putative venoms, aspartylglucosaminidase, has been previously identified as a major venom component in two distantly related parasitoid wasps (Asobara tabida and Leptopilina heterotoma) and may have originated via gene duplication within the Hymenoptera. Our study shows that M. spermotrophus, a specialized plant parasite, expresses putative venom transcripts that share homology to venoms identified in Nasonia vitripennis (both superfamily Chalcidoidea), which suggests that M. spermotrophus may have co-opted pre-existing machinery to develop as a plant parasite.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle