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Enregistrement W2412273740 · doi:10.1021/acs.biochem.6b00408

Discriminating Lipid– from Protein–Calcium Binding To Understand the Interaction between Recoverin and Phosphatidylglycerol Model Membranes

2016· article· en· W2412273740 sur OpenAlexafffund
Kim Potvin-Fournier, Thierry Lefèvre, Audrey Picard‐Lafond, Catherine Marcotte, Caroline Dufresne, Line Cantin, Christian Salesse, Michéle Auger

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensUniversité LavalRegroupement Québécois sur les Matériaux de PointePROTEOHôpital du Saint-Sacrement
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies
Mots-clésRecoverinCalciumChemistryPhosphatidylglycerolMembraneBiophysicsCalcium-binding proteinLipid microdomainBiochemistryRhodopsinPhospholipidBiologyPhosphatidylcholineOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recoverin is a protein involved in the phototransduction cascade by regulating the activity of rhodopsin kinase through a calcium-dependent binding process at the surface of rod outer segment disk membranes. Understanding how calcium modulates these interactions and how it interacts with anionic lipid membranes is necessary to gain insights into the function of recoverin. In this work, infrared spectroscopy allowed us to show that the availability of calcium to recoverin is modulated by the presence of complexes involving phosphatidylglycerol (PG), which in turn regulates its interactions with this negatively charged lipid. Calcium can indeed be sequestered into strongly bound complexes with PG and is thus sparingly available to recoverin. The thermal stability of recoverin then decreases, which results in weakened interactions with PG. By contrast, when calcium is fully available to recoverin, the protein is thermally stable, indicating that it binds two calcium ions, which results in favorable interactions with negatively charged lipids. Consequently, the protein induces an increase in the chain-melting phase transition temperature of PG, which is indicative of an enhanced lipid chain packing resulting from the peripheral location of the protein. The secondary structure of recoverin is not affected by its interactions with anionic membrane lipids. Similar results have been obtained with saturated and unsaturated anionic lipids. This work shows that the recruitment of recoverin at the surface of anionic lipid membranes is dependent on the availability of calcium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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