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Enregistrement W2412646424 · doi:10.1158/0008-5472.can-15-3455

Design and Reporting of Targeted Anticancer Preclinical Studies: A Meta-Analysis of Animal Studies Investigating Sorafenib Antitumor Efficacy

2016· review· en· W2412646424 sur OpenAlexafffund
James Mattina, Nathalie MacKinnon, Valerie C. Henderson, Dean Fergusson, Jonathan Kimmelman

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2016
Typereview
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSorafenibMedicineMeta-analysisOncologyInternal medicinePublication biasHepatocellular carcinomaCancerRenal cell carcinomaExternal validitySubgroup analysisClinical study designClinical trial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The validity of preclinical studies of candidate therapeutic agents has been questioned given their limited ability to predict their fate in clinical development, including due to design flaws and reporting bias. In this study, we examined this issue in depth by conducting a meta-analysis of animal studies investigating the efficacy of the clinically approved kinase inhibitor, sorafenib. MEDLINE, Embase, and BIOSIS databases were searched for all animal experiments testing tumor volume response to sorafenib monotherapy in any cancer published until April 20, 2012. We estimated effect sizes from experiments assessing changes in tumor volume and conducted subgroup analyses based on prespecified experimental design elements associated with internal, construct, and external validity. The meta-analysis included 97 experiments involving 1,761 animals. We excluded 94 experiments due to inadequate reporting of data. Design elements aimed at reducing internal validity threats were implemented only sporadically, with 66% reporting animal attrition and none reporting blinded outcome assessment or concealed allocation. Anticancer activity against various malignancies was typically tested in only a small number of model systems. Effect sizes were significantly smaller when sorafenib was tested against either a different active agent or combination arm. Trim and fill suggested a 37% overestimation of effect sizes across all malignancies due to publication bias. We detected a moderate dose-response in one clinically approved indication, hepatocellular carcinoma, but not in another approved malignancy, renal cell carcinoma, or when data were pooled across all malignancies tested. In support of other reports, we found that few preclinical cancer studies addressed important internal, construct, and external validity threats, limiting their clinical generalizability. Our findings reinforce the need to improve guidelines for the design and reporting of preclinical cancer studies. Cancer Res; 76(16); 4627-36. ©2016 AACR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,175
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,262
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens large)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil0,925

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1750,262
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0150,064
Bibliométrie0,0070,007
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,984
Tête enseignante GPT0,793
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
DomainePrésentation des résultats
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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