Construction and Analysis of Alphaherpesviruses Expressing Green Fluorescent Protein
Notice bibliographique
Résumé
Over the past 10 years, the use of fluorescently tagged herpesviruses has evolved from relative obscurity into a common component in the arsenal of many molecular herpesvirology laboratories. In this chapter we provide methods for construction and analysis of recombinant alphaherpesviruses using conventional co-transfection and homologous recombination procedures. In recent years many herpesviruses have been cloned into bacterial artificial chromosomes (BACs), which has facilitated their manipulation by sophisticated bacterial molecular genetic techniques [Messerle, M., Crnkovic, I., Hammerschmidt, W., Ziegler, H., and Koszinowski, U. H. (1997) Proc Natl Acad Sci USA 94,14759-63; Smith, G. A., and Enquist, L. W. (2000) Proc Natl Acad Sci USA 97,4873-8; Tischer, B. K., von Einem, J., Kaufer, B., and Osterrieder, N. (2006) Biotechniques 40,191-7]. These technological breakthroughs have allowed for the genetic analysis of virus gene products, including those that are essential for virus replication, with unprecedented ease. The main caveat to this approach is that one requires their virus strain of interest cloned into a BAC. If the virus strain under consideration has not been introduced into a BAC, it is far from trivial to do so. While comparatively antiquated, the procedures provided in this article can be used with any strain. Here we focus on pseudorabies virus (PRV), a swine pathogen, which is the alphaherpesvirus most amenable to genetic manipulation using this transfection-based approach.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».