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Enregistrement W2412883552 · doi:10.1097/mpg.0b013e3182605070

Commentaries on “Workshop Report

2012· letter· en· W2412883552 sur OpenAlexaboutno aff
Michael J. Rosen, Lee A. Denson, Subra Kugathasan

Notice bibliographique

RevueJournal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition · 2012
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCohortInflammatory bowel diseaseCohort studyBiobankDiseaseTranslational researchProspective cohort studyPopulationFamily medicineRisk stratificationPediatricsIntensive care medicineEnvironmental healthPathologyInternal medicineBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pediatric IBD studies have improved in quality and quantity because of multicenter collaborations rather than single-center reports. Carefully planned prospective cohort studies with biological materials are needed to translate new discoveries into clinical practice. In 2005, the Crohn's & Colitis Foundation of America (CCFA) established priorities in pediatric IBD science (1) and created a pediatric network with solid infrastructure, including financial sustainability, geographic diversity, and freedom from commercial bias, to undertake clinical trials, quality improvement projects, and translational research. This network has 43 centers across North America and has approximately 2000 newly diagnosed children with IBD enrolled in a translational research project. DNA, sera, stool, and intestinal biopsies taken at the time of diagnosis are banked, allowing eventual analyses for biomarkers and of “causal” models linking exposure to disease risk, disease progression, and risk stratification; however, the CCFA Pediatric Network remains a convenience cohort, prone to selection bias, and lacking the denominator data of a population-based cohort. A cohort that captures every single new diagnosis of IBD would be unique among existing IBD cohorts. A Canadian group is proposing the initiation of an exclusive pediatric IBD network and data platform that would accomplish this goal (2). The potential success of such a network centers around 2 unique strengths of Canadian pediatric IBD care: the vast majority of children with IBD in Canada are cared for by a relatively small number of centers, facilitating their chance to capture almost all of the pediatric patients with IBD in Canada; and the capability of linking with information-rich government administrative databases associated with the all-encompassing Canadian universal health care system. A few aspects of the proposed Canadian network will require further clarification. The goals for the network identified at this meeting remain broad. The investigators acknowledge that initial composition of infrastructure such as data platforms and biorepositories will need to be dictated by clear objectives. The design phase of the data management platform will inform the ability for data sharing within the existing network and enable future collaborative ancillary studies, which will capitalize on the increased power of a combined cohort. Mechanisms to support enrollment will need to be identified because the authors state that reimbursement for data collectors and study coordinators is unlikely in Canada. Enrolling patients and capturing follow-up visits in such a network, with careful attention to input of accurate data, requires a substantial amount of people power. Smaller centers will be challenged to participate without financial support for data collection. This could undermine the major strength of a true population-based cohort. For the CCFA Pediatric Network, the per-enrolled patient reimbursement structure is a key reason that enrollment rates have consistently exceeded expectations. A Canadian pediatric IBD research network will be a welcome addition and will complement existing networks. Successful implementation of a Canadian network will ensure a population-based IBD prospective cohort, routinely allowing the collection of several biological samples at different time points and facilitating the investigation of fundamental questions of disease pathogenesis and clinical course.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,080
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,293

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,080
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0070,003
Communication savante0,0080,006
Science ouverte0,0070,005
Intégrité de la recherche0,0410,044
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0880,048

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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