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Enregistrement W2414051035 · doi:10.1136/jmedgenet-2015-103577.17

MG-126 A <i>de novo</i> truncating mutation in the chromatin remodeler chd8 in a patient with autism, macrocephaly and overgrowth

2015· article· en· W2414051035 sur OpenAlexaff
PY Billie Au, Christopher Smith, Ryan E. Lamont, Hilary Racher, Jillian S. Parboosingh, François P. Bernier, A. Micheil Innes

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMacrocephalyExome sequencingAutismIntellectual disabilityGeneticsMutationHaploinsufficiencyBiologyPhenotypeShort statureChromodomainLoss functionExomeChromatinMedicineBioinformaticsGeneEndocrinologyPsychiatryHelicase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background CHD8 is one of a few genes in which de novo loss of function mutations have been identified in multiple cases across multiple autism cohorts in recent extensive exome sequencing studies. CHD8 is an ATP-dependent chromodomain helicase involved in chromatin remodelling and regulation of Wnt/beta-catenin and p53 pathways, which are pathways that have been implicated in non-syndromic and syndromic autism and intellectual disability. Objectives We will describe a patient with autism and intellectual disability with a novel CHD8 mutation. We also review the phenotype of previously reported patients with CHD8 loss of function mutations. Methods Exome sequencing of the proband and parents was used to identify de novo variants using the trio approach. A PubMed-based literature search identified other reported patients. Results Our patient has a de novo truncating CHD8 mutation (c.4342C >T, NM_020920). He is macrocephalic (>+3SD), and has extremely tall stature with proportionate weight (>+7SD), suggestive of an overgrowth phenotype. Other patients with CHD8 mutations that have been reported in the literature also have macrocephaly and a tendency to taller stature. Conclusions CHD8 mutations may cause syndromic autism. Further delineation of this phenotype will be helpful for diagnostic and prognostic guidance in the future. The association of a truncating CHD8 mutation with macrocephaly and overgrowth is particularly interesting since other disorders of chromatin remodelling implicated in the Wnt/beta-catenin pathway, such as Coffin-Siris and Weaver syndromes, also have abnormal neurodevelopment associated with altered head size and in some instances generalised overgrowth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
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