MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2414467383 · doi:10.1007/978-1-60761-849-2_17

Protocols of In Vitro Protein Covalent Binding Studies in Liver

2010· article· en· W2414467383 sur OpenAlexaff
Jean-François Lévesque, Stephen H. Day, Allen N. Jones

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensMerck Canada Inc. (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryCovalent bondEnzymeCytochrome P450ChemistryIn vitroDrugXenobioticDrug metabolismCovalent bindingMicrosomeAdductReactive intermediatePharmacologyElectrophileSmall moleculeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Xenobiotics, including therapeutic agents, can produce a variety of beneficial, as well as adverse, effects in mammals. One potential source of drug-mediated toxicity stems from metabolic activation of the parent compound, typically catalyzed by one or more members of the cytochrome P450 family of enzymes. The resulting electrophile, if not quenched by low molecular weight endogenous nucleophiles, can form covalent adducts to cellular proteins, potentially resulting in enzyme inactivation, cell death, or formation of an immunogenic species. The toxicological consequences of exposure to such reactive intermediates range from mild inflammation to organ failure, anaphylaxis, and death. At Merck Research Laboratories, the potential of drug candidates to bind covalently to proteins is evaluated at the lead optimization stage of drug discovery by incubating a radiolabeled analog of the compound in question with liver microsomal preparations (under oxidative conditions) or whole cells (full cellular metabolic capability), typically derived from rat and human liver. A semi-automated method based on the Brandel Harvester technique then is used to measure the formation of covalent adducts of the test compound to liver proteins. This assay is viewed as an important component of drug discovery programs, since the findings are employed to guide specific efforts to abrogate bioactivation issues through informed structural modification of lead compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,249
Tête enseignante GPT0,598
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMethods in molecular biologyMême sujetPharmacogenetics and Drug MetabolismTravaux en français237 207