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Enregistrement W2414816123 · doi:10.1094/pdis-12-15-1410-re

Race Characterization of <i>Puccinia striiformis</i> f. sp. <i>tritici</i>, the Cause of Wheat Stripe Rust, in Saskatchewan and Southern Alberta, Canada and Virulence Comparison with Races from the United States

2016· article· en· W2414816123 sur OpenAlexafffundabout
Gurcharn S. Brar, H. R. Kutcher

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaWestern Grains Research FoundationMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésPuccinia striiformisVirulenceBiologyRace (biology)TriticaleStripe rustPopulationVeterinary medicineGenetic diversityBotanyCultivarGeneticsPlant disease resistanceDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wheat stripe rust, caused by Puccinia striiformis f. sp. tritici, has been common across Saskatchewan, Canada since 2000. Fifty-nine isolates of P. striiformis f. sp. tritici, the majority of which were collected between 2011 and 2013 from Saskatchewan and southern Alberta, were analyzed for virulence frequency and diversity and compared with isolates characterized in the Pacific Northwest and Great Plains regions of the United States. In all, 31 wheat differentials, including 20 near-isogenic lines and 1 triticale variety, differentiated 59 P. striiformis f. sp. tritici isolates into 33 races, of which one race, C-PST-1, represented 31% of the isolates. None of the races were virulent on Yr5, Yr15, or YrSP. Virulence frequency ranged from 65 to 98% on YrA, Yr2, Yr8, Yr9, Yr27, Yr29, Yr32, YrSu, 'Heines VII', and 'Nord Deprez'. Race C-PST-6 was virulent on the greatest number of the differentials (n = 25) and C-PST-18 on the fewest (n = 14). Discriminant analysis of principal components and multivariate cluster analyses detected three and four major groups, respectively, which differed from each other in terms of virulence spectrum and year of collection. The diversity of the P. striiformis f. sp. tritici population in southern Alberta was greater than in Saskatchewan, which indicated that, although P. striiformis f. sp. tritici is primarily windborne over great distances and does not usually overwinter, there are detectable differences in virulence between these regions of western Canada. Comparative analyses of virulence frequency of Saskatchewan or southern Alberta isolates with isolates representing races from the Great Plains and the Pacific Northwest of the United States indicated greater similarity of Saskatchewan races to the Great Plains despite strong correlations with both parts of the United States. This suggests that the P. striiformis f. sp. tritici population in Saskatchewan is a mixture of inoculum from both parts of the United States.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,350
Score d'incertitude au seuil0,500

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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