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Enregistrement W2415134345 · doi:10.1016/j.gdata.2016.06.001

Identification of differentially expressed genes in sexed pig embryos during post-hatching development in primiparous sows exposed to differing intermittent suckling and breeding strategies

2016· article· en· W2415134345 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenomics Data · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal Behavior and Welfare Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAustralian Pork
Mots-clésLactationBiologyWeaningEstrous cycleBreedAnimal scienceHerdAndrologyPregnancyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of commercial pig breeding programs is to maximize the number of pigs produced per sow per year. Given that sows exhibit an estrus during lactation is a potential means of increasing productivity of a pig breeding herd without reducing in lactation length, conventionally, weaning of piglets at a relatively young age is often related to post-weaning piglet performance which compromises piglet welfare. Therefore, intermittent suckling (IS) is a management technique in which lactating sows are separated from their piglets for a fixed period of the days and allowing sows to continue nursing piglets while exhibiting estrus and being breed during lactation, thereby promoting both piglet well-being and sow reproductive performance [1]. For this study, primiparous sows (PP) were exposed to 28 day (D28) lactation with intermittent suckling (IS) during the final week prior to weaning. The sows detected to be in estrus during lactation were either bred at this first estrus (FE) during lactation (IS21FE), or were "skipped" and bred at their second estrus which occurred after final weaning at D28 (IS21SE). Despite the benefits of IS, the effects of the maternal physiology related to breeding during lactation on embryonic transcriptome are largely unknown. Recent advances in the ability to assess embryonic gene expression in both sexes have made these analyses possible. Here, we describe the experimental procedures of two color microarray analyses and annotation of differentially expressed (DE) genes in detail corresponding to data deposited at NCBI in the Gene Expression Omnibus under accession number GSE53576 and GSE73020 for day 9 embryos (D9E) and day 30 embryos (D30E) respectively. Although only a few DE genes were discovered between IS21FE and IS21SE in both sexes from D9E or D30E, the raw data are still valuable for future use to understand the gene expression profiling from two different developmental stages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,889
Score d'incertitude au seuil0,783

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle