Analysis of Interactions Between Viral Replicase Proteins and Plant Intracellular Membranes
Notice bibliographique
Résumé
Replication of the genome of positive-strand RNA plant viruses takes place in membrane-bound complexes that contain viral replicase proteins, viral RNA, and host proteins. Many viral replicase proteins play a crucial role in the assembly of replication complexes at intracellular membranes. They are integral membrane proteins that interact directly with the membranes and bring other proteins and the viral RNA to the complex via protein-protein or protein-RNA interactions. In this chapter, we describe subcellular fractionation methods that determine whether viral proteins are integral membrane proteins in planta. Differential centrifugation techniques are used to produce membrane-enriched fractions, which can then be analyzed for the presence of viral replicase proteins by immunoblotting. Confirmation of the membrane-association is obtained by membrane flotation assays and treatment of membrane-enriched fractions with high salt or high pH followed by detection of the viral proteins. Because many plant viruses replicate in association with the endoplasmic reticulum (ER), we also discuss two techniques to specifically analyze the interaction of viral proteins with these membranes. These techniques are continuous sucrose-gradient fractionation in the presence or absence of 3 mM Mg2+ and glycosylation assays.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».