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Enregistrement W2416033144 · doi:10.1093/femsle/fnv177

Spontaneous and on point: Do spontaneous mutations used for laboratory experiments cause pleiotropic effects that might confound bacterial infection and evolution assays?

2015· review· en· W2416033144 sur OpenAlexafffund
Lucas Robinson, Andrew D. S. Cameron, John Stavrinides

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPoint mutationBiologyGeneticsPhenotypeSelectable markerExperimental evolutionMutationAntibiotic resistanceAntibioticsMutantMutagenesisStreptomycinComputational biologyGenePlasmid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many selectable phenotypes in microbial systems, including antibiotic resistance, can be conferred by single point mutations. This is frequently exploited in research, where the selection and use of microbial mutants that are spontaneously resistant to antibiotics like rifampicin and streptomycin facilitate the recovery and/or quantification of a target microbe. Such mutations are commonly employed as genetic markers for in vitro and in vivo experiments, often with little consideration as to the ultimate system-level impact of these single nucleotide mutations on the physiology of the microbe. There is substantial literature on the pleiotropic effects of point mutations conferring antibiotic resistance; yet, it is unclear whether this work is considered by the research communities outside of the discipline. This review examines some of the known pleiotropic effects of point mutations that provide selectable resistance markers, and how these mutations may impact general physiology and growth in host and non-host environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,979
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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