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Enregistrement W2416431352 · doi:10.14712/fb2002048010009

Chromosomal Mapping of HCaRG, a Novel Hypertension-Related, Calcium-Regulated Gene

2002· article· en· W2416431352 sur OpenAlexafffund
Nicolas Solban, Pierre Dumas, Françis Gossard, Yan Sun, Michal Pravenec, Vladimı́r Křen, R. Lewanczuk, Pavel Hamet, Johanne Tremblay

Notice bibliographique

RevueFolia Biologica · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensUniversity of AlbertaCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGrantová Agentura České Republiky
Mots-clésGeneGeneticsCalciumBiologyComputational biologyCell biologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We recently identified a novel gene that is negatively regulated by extracellular calcium concentration with higher levels of transcripts in hypertensive animals (SHR). We named this gene HCaRG (Hypertension-related, Calcium-Regulated Gene). In this work we report the chromosomal localization of the HCaRG gene among different species. We identified a BglII RFLP between BN.lx and SHR rats. We then analysed the strain distribution pattern of this RFLP in 31 RIS, originating from BN.lx and SHR rats, and compared it to the segregation of 475 markers localized in the rat genetic map. Hcarg localizes to the rat chromosome 7 between the markers Mit3 and Mit4. This region is homologous to human chromosome 8q21-24. We identified three clones in Genbank that contain the sequence of HCaRG. It was therefore possible to narrow down the localization of human HCaRG to chromosome 8q24.3. Furthermore, a suggestive localization of mouse Hcarg based on conservation of linkage between human and mouse is on chromosome 15. We previously identified a putative calcium-binding motif (EF-Hand) and a nuclear receptor-binding domain (LxxLL) in the rat sequence of the HCaRG protein. Sequence comparison between five different species showed that these domains are highly conserved. Furthermore, a search of ESTs in Genbank for homologous sequences showed that HCaRG is expressed only in eukaryotes, particularly in mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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