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Enregistrement W2416565667 · doi:10.1038/hgv.2015.31

An association analysis of HLA-DQB1 with narcolepsy without cataplexy and idiopathic hypersomnia with/without long sleep time in a Japanese population

2015· article· en· W2416565667 sur OpenAlexaff
Taku Miyagawa, Hiromi Toyoda, Takashi Kanbayashi, Aya Imanishi, Yohei Sagawa, Nozomu Kotorii, Tatayu Kotorii, Yuji Hashizume, Kimihiro Ogi, Hiroshi Hiejima, Yuichi Kamei, Akiko Hida, Masayuki Miyamoto, Azusa Ikegami, Yamato Wada, Masanori Takami, Yota Fujimura, Yoshiyuki Tamura, Naoto Omata, Yasuhiro Masuya, Hideaki Kondo, Shunpei Moriya, Hirokazu Furuya, Mitsuhiro Kato, Hiroto Kojima, Koichi Kashiwase, Hiroh Saji, Seik‐Soon Khor, Maria Yamasaki, Jun Ishigooka, Yuji Wada, Shigeru Chiba, Naoto Yamada, Masako Okawa, Kenji Kuroda, Kazuhiko Kume, Koichi Hirata, Naohisa Uchimura, Tetsuo Shimizu, Yuichi Inoue, Yutaka Honda, Kazuo Mishima, Makoto Honda, Katsushi Tokunaga

Notice bibliographique

RevueHuman Genome Variation · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueSleep and Wakefulness Research
Établissements canadiensHealth Research Foundation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCataplexyNarcolepsyHuman leukocyte antigenExcessive daytime sleepinessAlleleHLA-DQB1Internal medicinePsychologyMedicineEndocrinologyGastroenterologySleep disorderPsychiatryGeneticsImmunologyInsomniaAntigenBiologyModafinilGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Narcolepsy without cataplexy (NA w/o CA) (narcolepsy type 2) is a lifelong disorder characterized by excessive daytime sleepiness and rapid eye movement (REM) sleep abnormalities, but no cataplexy. In the present study, we examined the human leukocyte antigen HLA-DQB1 in 160 Japanese patients with NA w/o CA and 1,418 control subjects. Frequencies of DQB1*06:02 were significantly higher in patients with NA w/o CA compared with controls (allele frequency: 16.6 vs. 7.8%, P=1.1×10(-7), odds ratio (OR)=2.36; carrier frequency: 31.3 vs. 14.7%, P=7.6×10(-8), OR=2.64). Distributions of HLA-DQB1 alleles other than DQB1*06:02 were compared between NA w/o CA and narcolepsy with cataplexy (NA-CA) to assess whether the genetic backgrounds of the two diseases have similarities. The distribution of the HLA-DQB1 alleles in DQB1*06:02-negative NA w/o CA was significantly different from that in NA-CA (P=5.8×10(-7)). On the other hand, the patterns of the HLA-DQB1 alleles were similar between DQB1*06:02-positive NA w/o CA and NA-CA. HLA-DQB1 analysis was also performed in 186 Japanese patients with idiopathic hypersomnia (IHS) with/without long sleep time, but no significant associations were observed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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