MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2416626104 · doi:10.1007/978-1-59745-194-9_12

Electroporation of Adherent Cells In Situ for the Study of Signal Transduction and Gap Junctional Communication

2008· article· en· W2416626104 sur OpenAlexaff
Leda Raptis, Adina Vultur, Heather L. Brownell, Evangelia Tomai, Aikaterini Anagnostopoulou, Rozanne Arulanandam, Jun Cao, Kevin Firth

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Inactivation Methods
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésElectroporationLucifer yellowCell biologyBiophysicsMaterials scienceTransfectionChemistryIntracellularNanotechnologyBiologyCell cultureGap junctionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cultured adherent cells can be electroporated in situ, as they grow on a glass slide coated with electrically conductive, optically transparent indium-tin oxide (ITO). Although the introduction of DNA is a common use, the technique of electroporation in situ is valuable for studying many aspects of signal transduction. This is because, under the appropriate conditions, in situ electroporation can be remarkably nontraumatic, while a large variety of molecules, such as peptides, oligonucleotides, or drugs, are introduced instantly and into essentially 100% of the cells, making this technique especially suitable for kinetic studies of effector activation. Following the introduction of the material, the cells can be either extracted or biochemically analyzed, or their morphology and gene expression can be examined by immunocytochemistry. In this chapter, we describe the introduction of a peptide blocking the Src-homology 2 domain of the adaptor Grb2 to inhibit the activation of the downstream effector Erk1/2 by EGF. The setup includes nonelectroporated, control cells growing side by side with the electroporated ones on the same type of ITO-coated surface. In a modified version, this assembly can be used very effectively for studying intercellular, junctional communication: cells are grown on a glass slide half of which is ITO-coated. An electric pulse is applied in the presence of the fluorescent dye lucifer yellow, causing its penetration into the cells growing on the conductive part of the slide, and the migration of the dye to the nonelectroporated cells growing on the nonconductive area is microscopically observed under fluorescence illumination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMethods in molecular biologyMême sujetMicrobial Inactivation MethodsTravaux en français237 207