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Enregistrement W2416684580 · doi:10.1089/fpd.2015.2106

Antimicrobial Resistance and Virulence Factors of <i>Escherichia coli</i> in Cheese Made from Unpasteurized Milk in Three Cities in Brazil

2016· article· en· W2416684580 sur OpenAlexaff
Laryssa Freitas Ribeiro, Mayhara Martins Cordeiro Barbosa, Fernanda de Rezende Pinto, Renato Pariz Maluta, M. C. Oliveira, Viviane de Souza, Maria Izabel Merino de Medeiros, Lucimara Antonio Borges, Luiz Augusto do Amaral, John M. Fairbrother

Notice bibliographique

RevueFoodborne Pathogens and Disease · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloPublic Health Agency
Mots-clésRaw milkPasteurizationVirulenceAntibiotic resistanceAmpicillinBiologyAntimicrobialMicrobiologyEscherichia coliTetracyclinePulsed-field gel electrophoresisFood scienceAntibioticsGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The production of cheeses from unpasteurized milk is still widespread in Brazil, even with a legal ban imposed on its marketing. The manufacture of this cheese is a public health problem, due to the use of raw milk and the poor hygienic conditions throughout the supply chain process. Contamination may occur from several sources and involve several different pathogenic microorganisms, such as Escherichia coli. The latter can cause different clinical manifestations depending on the pathotype involved. Furthermore, some isolates manifest antimicrobial resistance and may be a risk for public health. The purpose of the current study was to investigate the presence of potentially pathogenic E. coli in raw-milk cheese in Brazil and their possible risk to public health. A total of 83 cheeses were collected from three different cities and 169 E. coli isolates were characterized for the presence of enteropathogenic E. coli, Shigatoxigenic E. coli, enterotoxigenic E. coli, extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) virulence genes, phylogenetic type, antimicrobial resistance, O serogroup, and pulsed-field gel electrophoresis. The number of samples positive for E. coli was highest in Aracaju (90.32%, 28/31). The prevalence of samples positive for potential ExPEC genes was similar for Uberaba and Aracaju (23.07%); the most prevalent ExPEC virulence genes were tsh, iucD, and papC. Isolates from Uberaba had a higher prevalence of resistance to tetracycline (38.46%), amoxicillin/clavulanic acid (58.85%), and ampicillin (61.54%) than the other cities. Overall, antimicrobial resistance genes tetB, blaTEM, and blaCMY-2 were the most prevalent genes (26.32%, 15.79%, and 28.95%, respectively) and the most prevalent serotypes were O4 (8%), 018 (12%), and O23 (8%). Clones originating from the same regions and from different regions were observed. These results emphasize the presence of a potential danger for humans in the consumption of raw-milk cheeses in three cities in Brazil due to the presence of antimicrobial resistance, which should be monitored.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,522
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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