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Enregistrement W2416762270 · doi:10.1385/1-59259-046-2:181

Expression of MMPs and TIMPs in Mammalian Cells

2003· article· en· W2416762270 sur OpenAlexaff
Karen Yeow, Blaine Phillips, Paul Beaudry, Kevin J. Leco, Gillian Murphy, Dylan R. Edwards

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMatrix metalloproteinaseTransfectionCell cultureCell biologyBaby hamster kidney cellGene expressionHEK 293 cellsBiologyLuciferaseMutantRecombinant DNAChemistryMolecular biologyComputational biologyGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression of recombinant matrix metalloproteinases (MMPs) and tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMPs) in mammalian cells is an important step in their functional characterization. Also, transient transfection analysis of promoter constructs driving CAT or luciferase reporter genes is a mainstay of gene regulation studies. One of the critical advantages of mammalian expression over bacterial systems for production of functional proteins is that problems of refolding, which are particularly significant for the MMPs and TIMPs, are generally not encountered. Transient expression in COS cells is very rapid and can be useful in many situations, for instance to demonstrate activity or to compare the characteristics of mutant proteins. It can also generate sufficient quantities of protein for biochemical and cell biological studies, but most often bulk production will require stable expression. In this chapter we will discuss our experiences with transient expression in COS-1 and C3H 10T1/2 mouse fibroblasts, and describe two systems that we have used for constitutive stable expression, namely BHK (Baby Hamster Kidney) and the NS0 myeloma cell line. This chapter complements the information in Chapter 11 by Butler, d’Ortho, and Atkinson who have described stable, tetracycline-regulated expression of MT1-MMP in CHOL cells. Also, the reader should note that many expression vector systems are now available commercially, and we have not attempted here to provide comparisons.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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