O13.4 Cervicovaginal microbiome dysbiosis is associated with proteome changes related to alterations of the cervicovaginal mucosal barrier
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Vaginal microbiome (VMB) dysbiosis is associated with increased acquisition of HIV and sexually transmitted infections (STIs). Cervicovaginal inflammation and other changes to the mucosal barrier are thought to play important roles but human data are scarce. In this study, we compared the cervicovaginal proteome among women with different VMB compositions. Methods Cervicovaginal lavages of 50 Rwandan female sex workers with known VMB composition were selected for human proteome analysis using mass-spectrometry. These women were previously clustered into four VMB groups in order of increasing bacterial diversity: group 1 had a Lactobacillus crispatus-dominated VMB; group 2 a L. iners-dominated VMB; group 3 moderate dysbiosis; and group 4 severe dysbiosis. We compared relative protein abundances among these VMB groups using targeted (abundance of pre-defined mucosal barrier proteins) and untargeted (differentially abundant proteins among all human proteins identified) approaches. Results With increasing bacterial diversity, we found: mucus alterations (increasing mucin 5B and 5AC), cytoskeleton alterations (increasing actin-organising proteins; decreasing keratins and cornified envelope proteins), increasing cell death (using LDHA/B as biomarkers of cell death), altered proteolytic activity (increasing proteasome core complex proteins/proteases; decreasing antiproteases), altered antimicrobial peptide balance (increasing psoriasin, calprotectin, and histones; decreasing lysozyme and ubiquitin), increasing proinflammatory cytokines, and decreasing immunoglobulins IgG1/2. Conclusion The VMB is strongly associated with the cervicovaginal human proteome in this cohort of Rwandan women at high risk of HIV and other STIs. Although temporal relationships cannot be derived, our findings support the hypothesis that dysbiosis causes cervicovaginal inflammation and other detrimental changes to the mucosal barrier that may lead to increased HIV/STI acquisition. Disclosure of interest statement This work was funded by the Institute of Infection and Global Health of the University of Liverpool, the Aids Fonds Netherlands (project number 201102), European and Developing Countries Clinical Trials Partnership (project number CT.2005.33070.001) and the European Commission (CHAARM consortium). The authors declare no conflicts of interest.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».