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Enregistrement W2416802287 · doi:10.1136/sextrans-2015-052270.150

O13.4 Cervicovaginal microbiome dysbiosis is associated with proteome changes related to alterations of the cervicovaginal mucosal barrier

2015· article· en· W2416802287 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueSexually Transmitted Infections · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesEuropean and Developing Countries Clinical Trials Partnership
Mots-clésDysbiosisProteomeImmunologyMicrobiologyMicrobiomeMedicinePhysiologyBiologyBiochemistryBioinformaticsGut flora

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Introduction</h3> Vaginal microbiome (VMB) dysbiosis is associated with increased acquisition of HIV and sexually transmitted infections (STIs). Cervicovaginal inflammation and other changes to the mucosal barrier are thought to play important roles but human data are scarce. In this study, we compared the cervicovaginal proteome among women with different VMB compositions. <h3>Methods</h3> Cervicovaginal lavages of 50 Rwandan female sex workers with known VMB composition were selected for human proteome analysis using mass-spectrometry. These women were previously clustered into four VMB groups in order of increasing bacterial diversity: group 1 had a <i>Lactobacillus</i> crispatus-dominated VMB; group 2 a <i>L. iners</i>-dominated VMB; group 3 moderate dysbiosis; and group 4 severe dysbiosis. We compared relative protein abundances among these VMB groups using targeted (abundance of pre-defined mucosal barrier proteins) and untargeted (differentially abundant proteins among all human proteins identified) approaches. <h3>Results</h3> With increasing bacterial diversity, we found: mucus alterations (increasing mucin 5B and 5AC), cytoskeleton alterations (increasing actin-organising proteins; decreasing keratins and cornified envelope proteins), increasing cell death (using LDHA/B as biomarkers of cell death), altered proteolytic activity (increasing proteasome core complex proteins/proteases; decreasing antiproteases), altered antimicrobial peptide balance (increasing psoriasin, calprotectin, and histones; decreasing lysozyme and ubiquitin), increasing proinflammatory cytokines, and decreasing immunoglobulins IgG1/2. <h3>Conclusion</h3> The VMB is strongly associated with the cervicovaginal human proteome in this cohort of Rwandan women at high risk of HIV and other STIs. Although temporal relationships cannot be derived, our findings support the hypothesis that dysbiosis causes cervicovaginal inflammation and other detrimental changes to the mucosal barrier that may lead to increased HIV/STI acquisition. <h3>Disclosure of interest statement</h3> This work was funded by the Institute of Infection and Global Health of the University of Liverpool, the Aids Fonds Netherlands (project number 201102), European and Developing Countries Clinical Trials Partnership (project number CT.2005.33070.001) and the European Commission (CHAARM consortium). The authors declare no conflicts of interest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,338
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle