In Situ Hybridization of Meiotic Prophase Chromosomes
Notice bibliographique
Résumé
In preparations of highly condensed metaphase chromosomes, it is often difficult to resolve in situ hybridization signals of probes to nearby regions. This is in part, a result of traditional fixation procedures that use alcohol, acetic acid, and/or relatively strong ionic conditions, all of which can cause chromosome condensation. The limit of resolution may be improved by using free chromatin or DNA-halo preparations as described in Chapters 10 and 11 of this volume. An alternative method of detecting proximal DNA sequences is to use whole-mount, surface spread meiotic prophase chromosomes (, ), which have less condensed chromatin and a well defined axial core that is much longer than that of a metaphase chromosome. We have tested this system using two probes () against low-copy repeats, 5.5 map units apart on the X chromosome () as shown in Fig. 1. On metaphase chromosomes, these signals wereclose together and often overlapped. However, a distance of several micrometers separated the signals on pachytene chromosomes. This type of mapping is useful provided one keeps in mind that the chromatin is arranged in loops around a protein core, the synaptonemal complex (SC) (Fig. 2) (), and that these loops are of considerable size relative to those of the metaphase chromosome. Thus, a sequence at the top of a 5-μm loop could appear some distance from the SC loop attachment point, depending on how the loop settles during chromosome preparation. Therefore, the size of the loop limits the resolution of the probes a few μm apart. However, if the probes are very close together (a few megabases), the decondensed chromatin permits resolving signals from probes to adjacent loci or to cosmid probes of different regions within the same gene.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».