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Enregistrement W2417846343

[Molecular-biological characteristic of Yersinia enterocolitica circulating in various regions of Russian Federation].

2012· article· en· W2417846343 sur OpenAlexaboutno aff
Karimova Tv, Bogumil'chik Ea, Voskresenskaia Ea, Klimov Vt, Chesnokova Mv, Л. И. Иванов, Poutonen Tb, Vasil'eva Av, Gromova Tv

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYersinia bacterium, plague, ectoparasites research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésYersinia enterocoliticaVirulenceRussian federationSerotypeBiologyMicrobiologyPlasmidPathogenicityGeneVirologyBacteriaGeographyGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: Complex characteristic by phenotype signs and main virulence genes of Yersinia enterocolitica strains circulating in various regions of Russian Federation. MATERIALS AND METHODS: 46 strains of Y. enterocolitica of 2 - 4 biotypes and 401 strains of Y. enterocolitica IA biotype isolated in 15 administrative territories of Russian Federation (Siberian, Far Eastern, Northwestern, Urals Federal Districts) from infected people, rodents, agricultural animals, birds, the environment were studied. Phagotyping was performed in the reference laboratory of the Pasteur Institute (Paris). All the Y. enterocolitica cultures were studied for the presence of ail, ystB and ystA genes by PCR method. Presence of virulence plasmid pYVwas determined by gel electrophoresis by T. Kieser method. RESULTS: 447 strains of Y. enterocolitica biotype 1A and 2 - 4 were studied. Most of the strains belonged to serotypes O:3; O:9; O: 5; O: 6,30; O:6,31; O:7,8. Phagotyping was performed for part of the strains. Phagotypes Xz and Xo were determined in biotype 1A strains. 2 - 4 biotype strains circulating in Siberia and the Far East were characterized by phagotype VIII, X3 that are present in other countries, and phagotype Xz that is spread only in Russia. Phagotypes IXa, IXb, II that are characteristic for strains from Canada, South Africa, Japan were not detected in Russian Federation. All the strains of 2 - 4 biotypes had ail and ystA genes. Most of the recently isolated strains had pYV. The only pathogenicity factor detected in 81.3% of biotype 1A strains including 14 strains from patients was ystB gene. These infections were accompanied by an expressed clinical symptomatology of enteritis and enterocolitis. CONCLUSION: Isolation of 1A biotype strains from patients necessitates execution of diagnostic studies of intestinal yersiniosis in patients with diagnosis "acute intestinal infection of undetermined etiology".

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
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