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Enregistrement W2417912567 · doi:10.1136/jmedgenet-2015-103578.9

MG-109 Revisiting a clinical diagnosis 15 years later with the aid of whole exome sequencing: Osteopetrosis versus harderophorphyria

2015· article· en· W2417912567 sur OpenAlexaff
Roberto Mendoza‐Londono, Lucie Dupuis, Pekka Kannus, Taila Hartley, Eric Bareke, Kym M. Boycott

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatosplenomegalyOsteopetrosisExome sequencingMedicineGeneticsPathologyBiologyPhenotypeGeneDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3></h3> The advent of whole exome sequencing (WES) has revolutionised gene discovery and led to the identification of atypical phenotypes for well-known syndromes. Our case illustrates the phenotypic overlap between very different syndromes, harderoporphyria and infantile osteopetrosis, which was only resolved by WES. We report two siblings, both born with severe hepatosplenomegaly, jaundice, thrombocytopenia and anaemia. The eldest child had increased bone density on radiographs and was diagnosed with infantile osteopetrosis. Both children responded well to bone marrow transplant (BMT). Molecular testing was negative for genes involved in infantile osteopetrosis: <i>CLCN7, TCIRG1, OSTM1, TNFSF11A </i>and <i>PLEKHMI1</i>. Many years later, the family was offered whole exome sequencing to clarify the underlying molecular aetiology. The siblings were found to harbour a homozygous mutation (p. K404E) in the <i>CPOX</i> gene confirming a diagnosis harderoporphyria. No mutations were found in any known genes causing infantile osteopetrosis. Defects of heme biosynthesis enzymes result in porphyrias. Harderoporphyria is caused by homozygous mutations in the <i>CPOX</i> gene which encodes coproporphyrinogen oxidase. Individuals with harderoporphyria exhibit neonatal hyperbilirubinemia, hemolytic anaemia, hepatosplenomegaly and photosensitivity. Infantile osteopetrosis presents with increased bone density, reduction of bone marrow spaces leading to anaemia, hepatosplenomegaly, cranial nerves compression and severe growth failure. It is a lethal condition, but responds well to BMT. Given that both children had undergone BMT, their own hematopoietic precursors would have been replaced by those of the donor. Thus, they would not be expected to manifest a harderoporphyria phenotype. To our knowledge, there have been no reports of increased bone mineral density in patients with harderoporphyria. An initial clinical presentation suggesting a diagnosis infantile osteopetrosis was only challenged after the WES data returned. Since the siblings received BMT in the first year of life, it remains unknown whether increased bone density was a persistent finding. This case report illustrates the clinical utility of WES and the importance of establishing a definitive molecular diagnosis for appropriate genetic counselling and medical management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,368
Score d'incertitude au seuil0,498

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,172
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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