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Enregistrement W2417996935 · doi:10.1385/0-89603-381-3:165

Construction of a Genomic Map of H. pylori by Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE)

2003· article· en· W2417996935 sur OpenAlexaff
Nicholas Chang, Qin Jiang, Diane E. Taylor

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésPulsed-field gel electrophoresisGel electrophoresisField (mathematics)BiologyMicrobiologyComputational biologyMolecular biologyGeneticsGeneMathematicsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The inability of conventional gel electrophoresis to separate DNA molecules exceeding 50 kb in size led to the development of pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) by Schwartz et al, (1)in 1982. He introduced the concept of applying two alternating electric fields (i.e., pulsed-field) to separate DNA molecules greater than 50 kb embedded in an agarose gel matrix. Since then, many instruments based on this principle have been developed. For a discussion of various pulsed-field applications, see review articles by Lai et al. (2) and Crété et al. (3). It was shown that, under the influence of an electric field, a DNA molecule embedded in a gel matrix undergoes reorientation, elongation, and migration along the field toward the anode. When a second field is applied in an alternate direction, the DNA molecule must reorientate, elongate, and migrate along the direction of the new field. Larger DNA molecules will take longer to reorientate than smaller molecules; therefore the larger ones spend less time migrating down the gel than the smaller per pulse time. Consequently, larger DNA molecules will appear near the origin while the smaller molecules will migrate furthest. This principle becomes important when different fragment sizes of DNA are to be separated. PFGE has become an important tool for determining genome sizes, physical mapping of the chromosome, and localization of genes on the chromosome of prokaryotic micro-organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,782

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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